More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6433 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6433  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 621 aa  1260    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0045  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.93 
 
 		 556 aa  379  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.94 
 
 		 609 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1479  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.76 
 
 		 619 aa  363  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2475  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.22 
 
 		 621 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661723  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1393  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.78 
 
 		 580 aa  355  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6432  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.38 
 
 		 619 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0046  Zn-dependent protease-like protein  26.53 
 
 		 534 aa  155  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.13 
 
 		 443 aa  98.2  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0277  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.43 
 
 		 442 aa  97.8  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00851915  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.26 
 
 		 464 aa  92.8  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.83 
 
 		 475 aa  92  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.45 
 
 		 444 aa  90.5  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2390  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.04 
 
 		 446 aa  89.7  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.738622 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.28 
 
 		 469 aa  90.1  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  28.63 
 
 		 445 aa  89.4  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  0.000000000000258626 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.71 
 
 		 462 aa  89  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.72 
 
 		 483 aa  89  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  28.92 
 
 		 460 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.51 
 
 		 482 aa  88.2  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.93 
 
 		 497 aa  87.8  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.15 
 
 		 479 aa  87.8  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2693  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.42 
 
 		 442 aa  87.8  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  26.05 
 
 		 445 aa  87.4  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0473  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.17 
 
 		 473 aa  87.4  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1825  microcin-processing peptidase 2  29.17 
 
 		 473 aa  87.4  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.92 
 
 		 460 aa  87  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  27.94 
 
 		 460 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  28.12 
 
 		 481 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.22 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0613  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.33 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2337  microcin-processing peptidase 2  29.17 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.652541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1139  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.91 
 
 		 473 aa  85.5  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.41 
 
 		 482 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.74 
 
 		 481 aa  84  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  30.74 
 
 		 481 aa  84  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1921  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.93 
 
 		 476 aa  83.2  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.05 
 
 		 480 aa  83.6  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.502377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.94 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.94 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1093  microcin-processing peptidase 2  29.63 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  26.75 
 
 		 484 aa  82.8  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.35 
 
 		 490 aa  82.4  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.06 
 
 		 454 aa  82.8  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  28.04 
 
 		 497 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  28.04 
 
 		 497 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.67 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  28.04 
 
 		 497 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.96 
 
 		 508 aa  81.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002390  TldD protein probably a protease  26.95 
 
 		 481 aa  80.9  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.91 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2956  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.34 
 
 		 486 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4091  tldD protein  26.94 
 
 		 482 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.95 
 
 		 490 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1778  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.46 
 
 		 496 aa  79.7  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.15 
 
 		 486 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  24.18 
 
 		 481 aa  79.7  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3646  microcin-processing peptidase 2  28.34 
 
 		 486 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.55 
 
 		 486 aa  79.7  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  27.38 
 
 		 481 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3681  protease TldD  24.42 
 
 		 481 aa  79.3  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1166  putative modulator of DNA gyrase; TldD  25.7 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.564815  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1496  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.46 
 
 		 496 aa  79.7  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.768084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3156  microcin-processing peptidase 2  28.63 
 
 		 474 aa  79.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.702304 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.8 
 
 		 490 aa  79  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.58 
 
 		 437 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  27.38 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  27.38 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  27.38 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  27.38 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.18 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.68 
 
 		 482 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  28.74 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.68 
 
 		 482 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.68 
 
 		 482 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  28.29 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1487  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.94 
 
 		 486 aa  77.8  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0850  microcin-processing peptidase 2  28.4 
 
 		 486 aa  77.8  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.29 
 
 		 482 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  29.1 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.68 
 
 		 482 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0876014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.16 
 
 		 477 aa  77.4  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1309  putative modulator of DNA gyrase; TldD  26.18 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.102122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0512  putative modulator of DNA gyrase  27.42 
 
 		 490 aa  77  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1223  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.06 
 
 		 483 aa  76.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.1 
 
 		 482 aa  77  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4322  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.91 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.76 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  25.13 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0991  microcin-processing peptidase 2  28.46 
 
 		 486 aa  75.1  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  26.34 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0939  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.98 
 
 		 487 aa  75.1  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  28.05 
 
 		 498 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.5 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.312145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14421  putative modulator of DNA gyrase; TldD  26.81 
 
 		 481 aa  75.1  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  27.2 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3769  TldD protein  29.22 
 
 		 487 aa  74.7  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162647  normal  0.0283692 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4510  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.97 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal  0.913937 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2490  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.24 
 
 		 487 aa  74.7  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3327  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.69 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>