172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6432 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6432  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 619 aa  1246    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2475  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.51 
 
 		 621 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.99 
 
 		 609 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1479  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.99 
 
 		 619 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1393  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.28 
 
 		 580 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6433  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.38 
 
 		 621 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0046  Zn-dependent protease-like protein  26.7 
 
 		 534 aa  163  7e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0045  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.4 
 
 		 556 aa  162  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.97 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  26.88 
 
 		 467 aa  66.6  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.8 
 
 		 493 aa  63.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.85 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.62 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.15 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.19 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  26.13 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.1 
 
 		 443 aa  60.5  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  34.19 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.7 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.54 
 
 		 480 aa  59.7  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.502377 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.78 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.78 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.78 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  34.19 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.33 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.33 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  25.78 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.78 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.78 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0876014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.49 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  30.27 
 
 		 481 aa  56.6  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  25.44 
 
 		 497 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.86 
 
 		 445 aa  57  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.81 
 
 		 444 aa  56.2  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3327  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.25 
 
 		 482 aa  55.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0474  TldD protein  26.1 
 
 		 482 aa  55.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.68 
 
 		 490 aa  55.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.61 
 
 		 469 aa  55.1  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1825  microcin-processing peptidase 2  27.1 
 
 		 473 aa  55.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0473  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.1 
 
 		 473 aa  55.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1921  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.12 
 
 		 476 aa  54.7  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  26.2 
 
 		 481 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  26.82 
 
 		 480 aa  54.7  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.91 
 
 		 482 aa  54.3  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.71 
 
 		 435 aa  54.3  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.68 
 
 		 445 aa  53.9  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4091  tldD protein  25.8 
 
 		 482 aa  53.5  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  26.44 
 
 		 480 aa  53.5  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.79 
 
 		 479 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.15 
 
 		 454 aa  53.5  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.99 
 
 		 475 aa  53.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.24 
 
 		 457 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.58 
 
 		 480 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  25.83 
 
 		 481 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2043  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.67 
 
 		 486 aa  52.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.45 
 
 		 454 aa  52.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  31.45 
 
 		 484 aa  53.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  25.83 
 
 		 481 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.74 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  25.83 
 
 		 481 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  23.81 
 
 		 481 aa  52  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0276  microcin-processing peptidase 2  30.65 
 
 		 482 aa  52.4  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.26 
 
 		 490 aa  52.4  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.89 
 
 		 481 aa  51.6  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  26.89 
 
 		 481 aa  51.6  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.81 
 
 		 468 aa  51.6  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  26.74 
 
 		 481 aa  51.6  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.08 
 
 		 473 aa  51.6  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  25.53 
 
 		 481 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  24.86 
 
 		 480 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  28.23 
 
 		 481 aa  51.2  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  25.83 
 
 		 481 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  25.47 
 
 		 481 aa  50.8  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  26.3 
 
 		 481 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.3 
 
 		 481 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  28.69 
 
 		 479 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0512  putative modulator of DNA gyrase  29.63 
 
 		 490 aa  50.4  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  26.3 
 
 		 481 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1145  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.22 
 
 		 481 aa  50.8  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  26.3 
 
 		 481 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  30.65 
 
 		 483 aa  50.8  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.55 
 
 		 479 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  26.3 
 
 		 481 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  26.3 
 
 		 481 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  26.3 
 
 		 481 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.04 
 
 		 446 aa  50.4  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.66 
 
 		 477 aa  50.4  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  29.66 
 
 		 479 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.86 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  hitchhiker  0.00000000738048 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.4 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  25.64 
 
 		 449 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  26.58 
 
 		 480 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.84 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0277  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.7 
 
 		 442 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00851915  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  27.17 
 
 		 481 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  24.19 
 
 		 481 aa  49.7  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.87 
 
 		 462 aa  50.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.66 
 
 		 479 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  24.34 
 
 		 481 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>