5838 genes were found for organism Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 59    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
PSPTOA0001  CDS  NC_004633  351  1664  +  1314  replication protein RepA  NP_808663  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0002  CDS  NC_004633  1803  2228  +  426  ultraviolet light resistance protein A  NP_808664  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0003    NC_004633  2206  2469  +  264      normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0004  CDS  NC_004633  2530  3540  +  1011  phage integrase family site specific recombinase  NP_808665  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0005  CDS  NC_004633  5731  6561  -  831  type III effector HopAM1-2  NP_808666  normal  0.77538  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0006    NC_004633  6735  7748  +  1014      normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0007  CDS  NC_004633  7782  8255  -  474  hypothetical protein  NP_808667  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0008  CDS  NC_004633  8252  9136  -  885  ParB family partitioning protein  NP_808668  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0009  CDS  NC_004633  9357  10484  -  1128  ParaA family ATPase  NP_808669  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0010  CDS  NC_004633  11224  14193  -  2970  Tn3 family transposase  NP_808670  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0011  CDS  NC_004633  14315  14860  +  546  resolvase, putative  NP_808671  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0012  CDS  NC_004633  14914  16068  -  1155  type III effector HopX1  NP_808672  normal  0.38885  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0013  CDS  NC_004633  16332  17354  -  1023  ISPsy4, transposase  NP_808673  normal  0.292398  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0014  CDS  NC_004633  17627  18256  +  630  ParaA family ATPase  NP_808674  normal  0.308628  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0015  CDS  NC_004633  18277  18495  +  219  plasmid partition protein ParB, truncated  NP_808675  normal  0.454297  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0016    NC_004633  18865  19242  +  378      normal  0.394624  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0017  CDS  NC_004633  19718  20146  +  429  type III chaperone ShcO1  NP_808676  normal  0.15767  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0018  CDS  NC_004633  20399  21250  +  852  type III effector HopO1-1  NP_808677  normal  0.0402217  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0019  CDS  NC_004633  21259  22395  +  1137  type III effector HopT1-1  NP_808678  normal  0.212974  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0020    NC_004633  22604  22753  -  150      normal  0.103953  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0021  CDS  NC_004633  23291  23956  -  666  resolvase, putative  NP_808679  hitchhiker  0.00853796  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0022  CDS  NC_004633  24081  24662  +  582  hypothetical protein  NP_808680  hitchhiker  0.00175186  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0023  CDS  NC_004633  24612  24962  -  351  hypothetical protein  NP_808681  hitchhiker  0.00115594  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0024  CDS  NC_004633  25096  25473  +  378  hypothetical protein  NP_808682  hitchhiker  0.00016445  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0025  CDS  NC_004633  25520  26356  +  837  hypothetical protein  NP_808683  hitchhiker  0.0000725071  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0026  CDS  NC_004633  26414  26602  +  189  hypothetical protein  NP_808684  hitchhiker  0.0000335226  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0027  CDS  NC_004633  26676  26954  -  279  mobilization protein MobC, putative  NP_808685  hitchhiker  0.0000575546  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0028  CDS  NC_004633  27399  27728  +  330  mobilization protein MobB, putative  NP_808686  hitchhiker  0.00175153  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0029  CDS  NC_004633  27739  29691  +  1953  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  NP_808687  normal  0.0136618  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0030  CDS  NC_004633  30218  30841  -  624  glycosy hydrolase family protein  NP_808688  normal  0.0210043  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0031  CDS  NC_004633  31647  32828  -  1182  hypothetical protein  NP_808689  normal  0.110752  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0032  CDS  NC_004633  32908  34203  -  1296  levansucrase  NP_808690  normal  0.49796  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0033  CDS  NC_004633  34296  34694  +  399  hypothetical protein  NP_808691  normal  0.10205  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0034  CDS  NC_004633  34863  36812  -  1950  GGDEF domain/EAL domain-containing protein  NP_808692  normal  0.224173  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0035  CDS  NC_004633  37434  38135  +  702  GntR family transcriptional regulator  NP_808693  normal  0.840145  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0036  CDS  NC_004633  38204  39397  +  1194  hydroxyglutarate oxidase  NP_808694  normal  0.925555  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0037  CDS  NC_004633  39438  40784  +  1347  major facilitator family transporter  NP_808695  normal  0.729938  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0038  CDS  NC_004633  40825  41010  +  186  hypothetical protein  NP_808696  normal  0.571319  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0039  CDS  NC_004633  41032  41367  -  336  PbsX family transcriptional regulator  NP_808697  normal  0.81047  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0040  CDS  NC_004633  41631  42164  +  534  hypothetical protein  NP_808698  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0041  CDS  NC_004633  42480  42752  +  273  putative lipoprotein  NP_808699  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0042  CDS  NC_004633  42755  43246  +  492  pilT protein  NP_808700  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0043  CDS  NC_004633  43283  43756  +  474  traH protein, putative  NP_808701  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0044  CDS  NC_004633  43753  44553  +  801  relaxase  NP_808702  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0045  CDS  NC_004633  44550  45731  +  1182  type IV pilus biogenesis protein  NP_808703  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0046  CDS  NC_004633  46304  46513  +  210  hypothetical protein  NP_808704  normal  0.718018  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0047  CDS  NC_004633  46510  47061  +  552  endonuclease  NP_808705  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0048  CDS  NC_004633  47372  47659  +  288  traK protein  NP_808706  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0049  CDS  NC_004633  47811  51980  +  4170  DNA primase, putative  NP_808707  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0050  CDS  NC_004633  52006  52359  +  354  traL protein  NP_808708  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0051  CDS  NC_004633  52356  53063  +  708  traM protein  NP_808709  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0052  CDS  NC_004633  53120  54178  +  1059  traN protein  NP_808710  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0053  CDS  NC_004633  54184  55542  +  1359  traO protein  NP_808711  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0054  CDS  NC_004633  55584  56249  +  666  traP protein  NP_808712  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0055  CDS  NC_004633  56258  56800  +  543  traQ protein  NP_808713  normal  0.872055  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0056  CDS  NC_004633  56876  57271  +  396  traR protein  NP_808714  normal  0.708954  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0057  CDS  NC_004633  57315  57590  -  276  hypothetical protein  NP_808715  normal  0.8901  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0058  CDS  NC_004633  57568  57768  -  201  hypothetical protein  NP_808716  normal  0.963562  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0059  CDS  NC_004633  57953  58612  +  660  traT protein  NP_808717  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0060  CDS  NC_004633  58596  61643  +  3048  traU protein  NP_808718  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0061  CDS  NC_004633  61667  61903  +  237  hypothetical protein  NP_808719  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0062  CDS  NC_004633  61946  63160  +  1215  traW protein  NP_808720  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0063  CDS  NC_004633  63150  63752  +  603  traX protein  NP_808721  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0064  CDS  NC_004633  63781  65925  +  2145  traY protein  NP_808722  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0065  CDS  NC_004633  66269  66919  +  651  exclusion-determining protein, putative  NP_808723  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0066  CDS  NC_004633  67012  68211  +  1200  trbA protein  NP_808724  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0067  CDS  NC_004633  68297  69382  +  1086  trbB protein  NP_808725  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0068  CDS  NC_004633  69369  71657  +  2289  TraG/TraD family conjugal transfer protein  NP_808726  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0069  CDS  NC_004633  71685  72107  +  423  hypothetical protein  NP_808727  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0070  CDS  NC_004633  72068  72691  +  624  hypothetical protein  NP_808728  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0071  CDS  NC_004633  72879  73307  +  429  GntR family transcriptional regulator  NP_808729  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0001  CDS  NC_004578  339  1874  +  1536  chromosomal replication initiator protein DnaA  NP_789863  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0002  CDS  NC_004578  1913  3016  +  1104  DNA polymerase III, beta subunit  NP_789864  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0003  CDS  NC_004578  3039  4142  +  1104  DNA replication and repair protein RecF  NP_789865  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0004  CDS  NC_004578  4147  6564  +  2418  DNA gyrase, subunit B  NP_789866  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0005  CDS  NC_004578  7092  8798  +  1707  type I restriction-modification system, M subunit, putative  NP_789867  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0006  CDS  NC_004578  8861  10168  +  1308  type I restriction-modification system, S subunit, EcoA family  NP_789868  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0007  CDS  NC_004578  10179  11063  +  885  hypothetical protein  NP_789869  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0008  CDS  NC_004578  11067  14366  +  3300  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  NP_789870  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0009  CDS  NC_004578  14512  15741  -  1230  ISPsy3, transposase  NP_789871  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0011  CDS  NC_004578  16743  17453  +  711  hypothetical protein  NP_789872  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0012  CDS  NC_004578  17514  18017  +  504  hypothetical protein  NP_789873  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0013  CDS  NC_004578  17992  18561  +  570  hypothetical protein  NP_789874  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0014  CDS  NC_004578  18573  18863  -  291  hypothetical protein  NP_789875  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0015  CDS  NC_004578  19321  19932  +  612  hypothetical protein  NP_789876  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0016  CDS  NC_004578  19968  20435  +  468  hypothetical protein  NP_789877  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0017  CDS  NC_004578  20738  23143  -  2406  helicase/SNF2 family domain protein  NP_789878  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0018  CDS  NC_004578  23290  24099  -  810  ISPsy4, transposition helper protein  NP_789879  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0019  CDS  NC_004578  24096  25118  -  1023  ISPsy4, transposase  NP_789880  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0020  CDS  NC_004578  25187  25537  -  351  hypothetical protein  NP_789881  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0021  CDS  NC_004578  25556  27796  -  2241  hypothetical protein  NP_789882  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0022  CDS  NC_004578  28478  29323  +  846  DNA-binding protein  NP_789883  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0023  CDS  NC_004578  29320  29919  +  600  hypothetical protein  NP_789884  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0024  CDS  NC_004578  30850  30987  +  138  hypothetical protein  NP_789885  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0025  CDS  NC_004578  31338  31967  +  630  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  NP_789886  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0026  CDS  NC_004578  32022  33068  -  1047  hypothetical protein  NP_789887  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0027  CDS  NC_004578  33254  33976  +  723  hypothetical protein  NP_789888  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0028  CDS  NC_004578  33978  35933  +  1956  transposase  NP_789889  normal  0.680566  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0029  CDS  NC_004578  35933  36868  +  936  transposition helper protein  NP_789890  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0030  CDS  NC_004578  36881  38767  +  1887  hypothetical protein  NP_789891  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 59    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>