8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTOA0003 on replicon NC_004633
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004633  PSPTOA0003    100 
 
 		 264 bp  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTO_A0073    96.49 
 
 		 57 bp  97.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292018  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0736  umuC protein  84.69 
 
 		 246 bp  75.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1425  DNA-directed DNA polymerase  83.67 
 
 		 1281 bp  67.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2761  DNA-directed DNA polymerase  82.52 
 
 		 1281 bp  61.9  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0282343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2745  DNA-directed DNA polymerase  79.35 
 
 		 1275 bp  54  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0002  DNA polymerase V subunit UmuC  93.75 
 
 		 1272 bp  48.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0002  ultraviolet light resistance protein A  100 
 
 		 426 bp  46.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
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