More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTOA0009 on replicon NC_004633
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004633  PSPTOA0009  ParaA family ATPase  100 
 
 		 375 aa  771    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6063  plasmid partitioning ATPase ParA  49.87 
 
 		 374 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258105 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  26.47 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  29.39 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  26.47 
 
 		 259 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.52 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.55 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  25.18 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.52 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.61 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.1 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  31.15 
 
 		 397 aa  69.3  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.41 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3864  putative plasmid partitioning protein  25.54 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  25.87 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.94 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  25.1 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  27.8 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.1 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.71 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  27.11 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.46 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.15 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45520  putative plasmid partitioning protein  27 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.922179 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.2 
 
 		 265 aa  67  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.01 
 
 		 263 aa  66.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2798  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.11 
 
 		 262 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.519748  normal  0.161878 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0930  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.1 
 
 		 269 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22160  chromosome partitioning ATPase  29.12 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.08 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.88 
 
 		 253 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1986  ParA family protein  24.27 
 
 		 262 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0990  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.62 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  22.66 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3430  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.85 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.88 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.73 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  27.84 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.06 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2257  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.95 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69947  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  25.38 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.26 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.03 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.73 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.03 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1532  SpoOJ regulator protein  28.91 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0987  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.25 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.294918  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.38 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3274  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.23 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  24.43 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4177  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.13 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1410  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.36 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 		 259 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  28.63 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  25.09 
 
 		 265 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  27.39 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  26.8 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0255  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.46 
 
 		 249 aa  62.4  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.21 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.41 
 
 		 286 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1058  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.97 
 
 		 259 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.91 
 
 		 265 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  28.57 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0095  ParA family chromosome partitioning ATPase  27.32 
 
 		 261 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1320  chromosome segregation ATPase  23.62 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.72 
 
 		 289 aa  62  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.1 
 
 		 284 aa  62  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0107  ParA family chromosome partitioning ATPase  27.32 
 
 		 261 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  23.67 
 
 		 257 aa  62  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  28.49 
 
 		 293 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0135  ParA family chromosome partitioning ATPase  27.32 
 
 		 261 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  26.96 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  25.38 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0359  sporulation initiation inhibitor protein soj  28.46 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00437391  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  27.44 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0442  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.26 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.72 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.72 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.44 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.68 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1728  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.98 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3751  chromosome segregation ATPase  27.72 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626525  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.73 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  23.93 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  23.6 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  29.35 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.02 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.91 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  26.37 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5090  ParA family protein  27.5 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  23.18 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.63 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  25.09 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.49 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.71 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.71 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.71 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>