11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTOA0060 on replicon NC_004633
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004632  PSPTO_B0066  traU protein  98.72 
 
 		 1018 aa  2080    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.865  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0060  traU protein  100 
 
 		 1015 aa  2100    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0088  TraU  49.46 
 
 		 1014 aa  1042    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.83032 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0498  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1009 aa  360  7e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0522  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1009 aa  360  9e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0376  IcmB  27.77 
 
 		 1003 aa  339  9.999999999999999e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1806  IcmB protein  27.77 
 
 		 1003 aa  339  9.999999999999999e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3870  DotO  27.37 
 
 		 1018 aa  308  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.103513  normal  0.825966 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0121  putative type IV secretion system protein IcmB/DotO  24.98 
 
 		 1031 aa  293  8e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4253  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1019 aa  229  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5592  hypothetical protein  24.46 
 
 		 995 aa  211  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0517129  normal  0.0408672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>