718 genes were found for organism Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 8    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CNC00010  CDS  NC_006685  1984  3809  +  1826  hypothetical protein  XP_569349  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00020  CDS  NC_006685  4572  6132  -  1561  conserved hypothetical protein  XP_569351  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00030  CDS  NC_006685  7518  10589  -  3072  expressed protein  XP_569353  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00040  CDS  NC_006685  11105  14777  +  3673  expressed protein  XP_569355  normal  0.685236  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00050  CDS  NC_006685  19049  23574  -  4526  chitin synthase, putative  XP_569357  normal  0.881569  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00060  CDS  NC_006685  24167  26835  -  2669  sugar transporter, putative  XP_569359  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00070    NC_006685  27638  29297  +  1660      normal  0.477274  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00080  CDS  NC_006685  28347  30497  -  2151  expressed protein  XP_569362  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00090  CDS  NC_006685  30765  31337  +  573  conserved hypothetical protein  XP_569365  normal  0.269581  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00100  CDS  NC_006685  31726  33431  -  1706  RNA helicase, putative  XP_569367  normal  0.685498  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00110  CDS  NC_006685  34913  36922  +  2010  fatty acid elongase, putative  XP_569369  normal  0.424466  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00120  CDS  NC_006685  37007  38665  -  1659  manganese ion homeostasis-related protein, putative  XP_569373  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00130  CDS  NC_006685  38879  41216  +  2338  hypothetical protein  XP_569375  normal  0.997572  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00140  CDS  NC_006685  45400  47426  -  2027  expressed protein  XP_569377  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00150    NC_006685  48108  50602  +  2495      normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00160  CDS  NC_006685  50645  52790  -  2146  phosphopyruvate hydratase, putative  XP_569379  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00170  CDS  NC_006685  53564  55457  -  1894  expressed protein  XP_569381  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00180  CDS  NC_006685  55549  57274  -  1726  histone lysine N-methyltransferase, putative  XP_569384  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00190  CDS  NC_006685  57930  59003  -  1074  hydrolase, putative  XP_569386  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00200  CDS  NC_006685  59405  60418  +  1014  conserved hypothetical protein  XP_569388  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00210  CDS  NC_006685  60441  62344  -  1904  conserved hypothetical protein  XP_569390  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00220  CDS  NC_006685  62618  65352  -  2735  CTP synthase, putative  XP_569392  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00230  CDS  NC_006685  65944  66704  -  761  ER to Golgi transport-related protein, putative  XP_569394  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00240  CDS  NC_006685  67161  67936  +  776  ribosomal large subunit biogenesis-related protein, putative  XP_569396  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00250  CDS  NC_006685  68265  74795  -  6531  hypothetical protein  XP_569398  normal  0.215441  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00260  CDS  NC_006685  75371  79133  +  3763  conserved hypothetical protein  XP_569400  normal  0.269491  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00270  CDS  NC_006685  79494  81810  -  2317  multiple drug resistance protein, putative  XP_569402  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00280    NC_006685  82687  84362  +  1676      normal  0.29349  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00290  CDS  NC_006685  84908  86961  -  2054  multiple drug resistance protein, putative  XP_569405  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00300  CDS  NC_006685  88126  92215  -  4090  hypothetical protein  XP_569407  normal  0.182785  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00310  CDS  NC_006685  92683  93332  +  650  Hmp1 protein, putative  XP_569409  normal  0.664316  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00320  CDS  NC_006685  93470  95826  -  2357  hypothetical protein  XP_569840  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00330  CDS  NC_006685  99183  99931  -  749  bud site selection-related protein, putative  XP_569411  normal  0.774468  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00340  CDS  NC_006685  100287  101874  +  1588  conserved hypothetical protein  XP_569413  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00350  CDS  NC_006685  101916  103978  -  2063  ribosomal protein, putative  XP_569415  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00360  CDS  NC_006685  104759  107684  +  2926  protein phosphatase type 2C, putative  XP_569418  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00370  CDS  NC_006685  107982  110389  -  2408  polyamine transporter, putative  XP_569420  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00380  CDS  NC_006685  111147  113580  +  2434  expressed protein  XP_569328  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00390  CDS  NC_006685  113953  115415  -  1463  hypothetical protein  XP_569329  normal  0.718611  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00400  CDS  NC_006685  116053  116952  +  900  cytoplasm protein, putative  XP_569330  normal  0.0490868  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00410  CDS  NC_006685  117792  120474  +  2683  hypothetical protein  XP_569331  normal  0.0252684  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00420  CDS  NC_006685  121518  123676  +  2159  hypothetical protein  XP_569332  normal  0.0136325  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00430  CDS  NC_006685  124081  125593  +  1513  expressed protein  XP_569333  normal  0.0307626  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00440  CDS  NC_006685  125733  126605  -  873  conserved hypothetical protein  XP_569334  normal  0.0533687  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00450  CDS  NC_006685  128144  129079  -  936  hypothetical protein  XP_569335  normal  0.215584  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00460  CDS  NC_006685  130466  132418  +  1953  SNARE binding protein, putative  XP_569336  normal  0.89668  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00470  CDS  NC_006685  132527  133908  -  1382  conserved hypothetical protein  XP_569337  normal  0.216367  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00480  CDS  NC_006685  134106  136254  +  2149  conserved hypothetical protein  XP_569338  normal  0.106158  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00490  CDS  NC_006685  136566  140292  -  3727  potassium ion transporter, putative  XP_569339  normal  0.240634  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00500  CDS  NC_006685  143485  145723  -  2239  3'-5' exonuclease, putative  XP_569340  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00510  CDS  NC_006685  145851  147601  +  1751  conserved hypothetical protein  XP_569341  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00520  CDS  NC_006685  147579  149224  -  1646  hypothetical protein  XP_569342  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00530    NC_006685  149379  150301  +  923      normal  0.315356  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00540  CDS  NC_006685  151938  153402  -  1465  conserved hypothetical protein  XP_569343  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00550  CDS  NC_006685  154350  155387  +  1038  conserved hypothetical protein  XP_569344  normal  0.584105  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00560  CDS  NC_006685  155391  157621  -  2231  hypothetical protein  XP_569345  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00570  CDS  NC_006685  159150  162208  +  3059  conserved hypothetical protein  XP_569346  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00580  CDS  NC_006685  162245  163302  -  1058  N-acetylglucosaminylphosphatidylinositol deacetylase, putative  XP_569842  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00590  CDS  NC_006685  163539  164556  +  1018  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  XP_569347  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00600  CDS  NC_006685  169138  175588  +  6451  conserved hypothetical protein  XP_569348  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00610    NC_006685  173298  174819  -  1522      normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00620  CDS  NC_006685  176069  180464  -  4396  hypothetical protein  XP_569350  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00630  CDS  NC_006685  180689  182318  +  1630  hypothetical protein  XP_569352  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00640  CDS  NC_006685  182468  184324  -  1857  expressed protein  XP_569354  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00650  CDS  NC_006685  184633  185611  +  979  expressed protein  XP_569841  normal  0.639483  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00660  CDS  NC_006685  186993  190469  +  3477  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  XP_569356  normal  0.665335  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00670  CDS  NC_006685  190671  194144  -  3474  nucleus protein, putative  XP_569358  normal  0.86397  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00680  CDS  NC_006685  194979  197496  -  2518  hypothetical protein  XP_569360  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00690  CDS  NC_006685  197780  198933  +  1154  chaperone regulator, putative  XP_569364  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00700  CDS  NC_006685  198946  200430  -  1485  PRCDNA38, putative  XP_569366  normal  0.637781  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00710  CDS  NC_006685  201585  202396  -  812  pyrophosphatase, putative  XP_569368  normal  0.381364  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00720  CDS  NC_006685  205111  209504  +  4394  conserved hypothetical protein  XP_569954  decreased coverage  0.00839319  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00730  CDS  NC_006685  210638  211251  -  614  hypothetical protein  XP_569370  normal  0.161164  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00740  CDS  NC_006685  213201  216212  +  3012  conserved hypothetical protein  XP_569374  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00750    NC_006685  214862  216173  -  1312      normal  0.6693  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00760  CDS  NC_006685  217274  219019  +  1746  conserved hypothetical protein  XP_569376  normal  0.751145  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00770    NC_006685  217858  219019  -  1162      normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00780  CDS  NC_006685  219350  222584  -  3235  histone deacetylase clr3, putative  XP_569378  normal  0.568291  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00790  CDS  NC_006685  222743  224767  +  2025  RNA-binding protein, putative  XP_569380  normal  0.253852  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00800  CDS  NC_006685  224941  227592  +  2652  biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase, putative  XP_569382  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00810  CDS  NC_006685  228432  231525  -  3094  gamma-tubulin complex component 3 (gcp-3), putative  XP_569385  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00820  CDS  NC_006685  232093  234135  +  2043  conserved hypothetical protein  XP_569387  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00830  CDS  NC_006685  234188  236344  -  2157  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  XP_569389  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00840  CDS  NC_006685  236562  239309  +  2748  expressed protein  XP_569955  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00850  CDS  NC_006685  243460  246016  +  2557  transporter, putative  XP_569391  normal  0.652064  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00860  CDS  NC_006685  246508  247301  -  794  hypothetical protein  XP_569393  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00870  CDS  NC_006685  250472  252868  +  2397  Mih1p, putative  XP_569395  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00880  CDS  NC_006685  253351  256659  -  3309  expressed protein  XP_569397  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00890  CDS  NC_006685  257888  260275  +  2388  hypothetical protein  XP_569399  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00900  CDS  NC_006685  260901  267108  +  6208  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  XP_569401  normal  0.626607  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00910  CDS  NC_006685  267831  269575  +  1745  hypothetical protein  XP_569404  normal  0.0259364  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00920  CDS  NC_006685  269864  272073  -  2210  glutamate dehydrogenase (NADP+), putative  XP_569406  normal  0.382106  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00930  tRNA  NC_006685  272703  272784  +  82  tRNA-Gln    normal  0.403952  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00940  CDS  NC_006685  274922  280619  -  5698  vacuolar membrane protein, putative  XP_569408  normal  0.31948  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00950  CDS  NC_006685  281578  286424  +  4847  conserved hypothetical protein  XP_569410  normal  0.148388  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00960  CDS  NC_006685  286488  287785  -  1298  late endosome to vacuole transport-related protein, putative  XP_569412  normal  0.429052  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00970  CDS  NC_006685  288224  289428  -  1205  conserved hypothetical protein  XP_569414  decreased coverage  0.00651288  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00980  CDS  NC_006685  289980  290634  +  655  expressed protein  XP_569416  normal  0.0317149  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC00990  CDS  NC_006685  290756  292071  -  1316  ATP synthase, putative  XP_569417  normal  0.0272026  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNC01000  CDS  NC_006685  292119  293842  +  1724  conserved hypothetical protein  XP_569419  normal  0.0427399  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 8    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8    next >  last >>