35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC00970 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC00970  conserved hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  657    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00651288  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6077  beta-lactamase domain protein  37.46 
 
 
267 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4844  beta-lactamase-like protein  35.59 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2296  hydrolase  32.86 
 
 
273 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000420805  hitchhiker  9.85282e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3417  metallo-beta-lactamase family protein  31.96 
 
 
275 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1011  beta-lactamase-like protein  34.86 
 
 
269 aa  166  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1828  metallo-beta-lactamase family protein  31.49 
 
 
274 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.197317  normal  0.1554 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3119  metallo-beta-lactamase family protein  30.8 
 
 
275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3212  metallo-beta-lactamase family protein  30.8 
 
 
275 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3465  metallo-beta-lactamase family protein  30.8 
 
 
274 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3190  metallo-beta-lactamase family protein  30.8 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.418134  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0984  beta-lactamase-like protein  33.57 
 
 
270 aa  162  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.332449 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3431  metallo-beta-lactamase family protein  30.8 
 
 
275 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0947  beta-lactamase-like protein  33.57 
 
 
270 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3444  metallo-beta-lactamase family protein  30.8 
 
 
275 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3108  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 
276 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00377228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3428  hypothetical protein  30.8 
 
 
274 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.553112  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4786  beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 
270 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423715  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1780  beta-lactamase-like protein  30.99 
 
 
263 aa  156  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0923  beta-lactamase-like protein  32.38 
 
 
270 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.911847  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1367  hydrolase  32.13 
 
 
271 aa  152  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  0.244008 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01947  metallo-beta-lactamase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12770)  31.36 
 
 
318 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.482558  normal  0.183653 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1968  hydrolase  31.29 
 
 
270 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5726  beta-lactamase-like protein  32.03 
 
 
270 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0592  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 
284 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3295  beta-lactamase-like protein  29.12 
 
 
279 aa  132  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.796583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1316  hypothetical protein  31.8 
 
 
235 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.851569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2342  hypothetical protein  51.32 
 
 
112 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.303536  normal  0.348773 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3429  hypothetical protein  26.64 
 
 
311 aa  62.8  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024687  hitchhiker  0.00959363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1022  hypothetical protein  24.44 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4894  hypothetical protein  23.08 
 
 
287 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4969  hypothetical protein  22.01 
 
 
290 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0907  hypothetical protein  22.01 
 
 
291 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.127065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5022  hypothetical protein  21.62 
 
 
290 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.594748 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4506  hypothetical protein  21.24 
 
 
290 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.898887  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>