46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC00050 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006683  CNN02110  chitin synthase, putative  47.13 
 
 		 996 aa  700    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65597  chitin synthase 2  49.02 
 
 		 959 aa  728    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.185541 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42812  chitin synthase  39.84 
 
 		 997 aa  675    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.676694 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29807  chitin synthase  44.18 
 
 		 866 aa  649    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.532192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51281  chitin synthase 2.2  46.91 
 
 		 1001 aa  692    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02520  chitin synthase 1, putative  47.11 
 
 		 947 aa  676    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.616261  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00050  chitin synthase, putative  100 
 
 		 1024 aa  2126    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.881569  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04566  Chitin synthase C (EC 2.4.1.16)(Chitin-UDP acetyl-glucosaminyl transferase C)(Class-I chitin synthase C) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P30583]  55.05 
 
 		 918 aa  876    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0856181  normal  0.834607 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07032  Chitin synthase A (EC 2.4.1.16)(Chitin-UDP acetyl-glucosaminyl transferase A)(Class-II chitin synthase A) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P30584]  53.32 
 
 		 1013 aa  823    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02523  Chitin synthase B (EC 2.4.1.16)(Chitin-UDP acetyl-glucosaminyl transferase B)(Class-III chitin synthase B) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00757]  44.27 
 
 		 916 aa  620  1e-176  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.154622 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04367  chitin synthase 2 (Eurofung)  41.85 
 
 		 905 aa  577  1.0000000000000001e-163  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03240  chitin synthase, putative  44.81 
 
 		 755 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00799  conserved hypothetical protein  24.59 
 
 		 797 aa  255  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.70319  normal  0.0518481 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2239  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  24.29 
 
 		 1023 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.716202  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2552  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  23.47 
 
 		 1003 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3564  bifunctional enzyme including aminotransferase and chitin synthase protein  24.6 
 
 		 641 aa  126  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2117  chitin synthase  25.27 
 
 		 628 aa  124  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.110823  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1390  chitin synthase  24.49 
 
 		 573 aa  110  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02270  chitin synthase 4, putative  27.1 
 
 		 1423 aa  86.7  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.240777  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01555  Chitin synthase D (EC 2.4.1.16)(Chitin-UDP acetyl-glucosaminyl transferase D)(Class-V chitin synthase D) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P78611]  31.82 
 
 		 1194 aa  84  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.058533  normal  0.103858 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04660  chitin synthase 1, putative  30.48 
 
 		 1236 aa  82.8  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29105  chitin-UDP acetyl-glucosaminyl transferase 3  30.63 
 
 		 1202 aa  82.4  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.196175  hitchhiker  0.000301151 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37908  transmembrane chitin synthase  27.06 
 
 		 933 aa  80.5  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01610  chitin synthase-related  30.73 
 
 		 1895 aa  80.9  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06317  Chitin synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q2L6A0]  29.38 
 
 		 1739 aa  77.8  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05300  chitin synthase 6, putative  31.02 
 
 		 1271 aa  73.6  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06318  Chitin synthasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13281]  24.26 
 
 		 1852 aa  72.8  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44759  transmembrane chitin synthase, glycosaminyl transferas  24.22 
 
 		 904 aa  67.8  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.611486  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 		 1002 aa  58.5  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  27.07 
 
 		 1124 aa  56.6  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  27.37 
 
 		 1120 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  25.57 
 
 		 1118 aa  53.5  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 789 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01046  hypothetical protein similar to chitin synthase class VII (Eurofung)  25.4 
 
 		 739 aa  52.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.661748 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 789 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 789 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  28.41 
 
 		 1101 aa  51.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3373  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 		 483 aa  48.5  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  27.53 
 
 		 872 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.53 
 
 		 1115 aa  47  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.53 
 
 		 1115 aa  47  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.53 
 
 		 1115 aa  47  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  27.22 
 
 		 445 aa  46.6  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  27.53 
 
 		 1119 aa  47  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  27.53 
 
 		 1115 aa  47  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  27.53 
 
 		 927 aa  47  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>