129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC00450 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC00450  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  537  9.999999999999999e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.215584  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.48 
 
 		 488 aa  55.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.478605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  24.86 
 
 		 603 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.14 
 
 		 881 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.57 
 
 		 608 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  23.16 
 
 		 601 aa  52.8  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0436  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  29.05 
 
 		 503 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05092  telomere-associated RecQ helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14720)  28.48 
 
 		 1571 aa  51.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.154319 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25 
 
 		 615 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4553  ATP-dependent DNA helicase RecQ  24.81 
 
 		 864 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0416  ATP-dependent DNA helicase RecQ  24.35 
 
 		 725 aa  50.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.65575 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.14 
 
 		 707 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.29 
 
 		 609 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  26.14 
 
 		 611 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1831  ATP-dependent DNA helicase RecQ  24.78 
 
 		 655 aa  50.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1996  ATP-dependent DNA helicase RecQ  24.72 
 
 		 629 aa  50.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25 
 
 		 608 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.14 
 
 		 609 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.14 
 
 		 611 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.4 
 
 		 674 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.14 
 
 		 611 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.73 
 
 		 606 aa  49.7  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.65 
 
 		 736 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  24.43 
 
 		 717 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.14 
 
 		 609 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.14 
 
 		 609 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.14 
 
 		 609 aa  49.7  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.96 
 
 		 762 aa  49.3  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0017  ATP-dependent DNA helicase RecQ  23.56 
 
 		 681 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.571196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  23.6 
 
 		 715 aa  48.9  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  25.57 
 
 		 611 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.68 
 
 		 647 aa  48.5  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  25.57 
 
 		 609 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.93 
 
 		 591 aa  48.5  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  31.63 
 
 		 1051 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36797  predicted protein  26.98 
 
 		 465 aa  48.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  22.29 
 
 		 601 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.57 
 
 		 615 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.57 
 
 		 615 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.57 
 
 		 615 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.57 
 
 		 615 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5465  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  26.61 
 
 		 637 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1359  DEAD/DEAH box helicase  25 
 
 		 681 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0443  ATP-dependent DNA helicase RecQ  24.74 
 
 		 685 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.12 
 
 		 725 aa  47.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.43 
 
 		 713 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.57 
 
 		 615 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4141  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  29.29 
 
 		 426 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.338645 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  23.2 
 
 		 601 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  24.02 
 
 		 602 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  30.61 
 
 		 1061 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1895  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  21.21 
 
 		 633 aa  47  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  23.43 
 
 		 705 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  23.46 
 
 		 779 aa  47  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3334  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.26 
 
 		 679 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  28.95 
 
 		 1086 aa  47  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.81 
 
 		 707 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0621  DNA helicase  28.28 
 
 		 1715 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  23.56 
 
 		 624 aa  46.6  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0027  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.91 
 
 		 681 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0879817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.83 
 
 		 543 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  24.62 
 
 		 710 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  23.3 
 
 		 599 aa  46.2  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  24.86 
 
 		 698 aa  46.2  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1535  ATP-dependent DNA helicase RecQ  23.56 
 
 		 596 aa  46.2  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.297932  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  29.79 
 
 		 788 aa  46.2  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.23 
 
 		 451 aa  45.8  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  23.16 
 
 		 614 aa  45.4  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  23.86 
 
 		 607 aa  45.4  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.78 
 
 		 592 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2113  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.57 
 
 		 481 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710868  normal  0.458371 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1290  ATP-dependent DNA helicase RecQ  24.86 
 
 		 616 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.289447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  22.16 
 
 		 602 aa  44.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  24 
 
 		 493 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  22.53 
 
 		 599 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04000  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.37 
 
 		 1134 aa  45.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.544211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3238  helicase domain protein  32 
 
 		 463 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18280  predicted protein  24.35 
 
 		 504 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.14 
 
 		 626 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.14 
 
 		 709 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  23.03 
 
 		 608 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  24.12 
 
 		 709 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1185  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.51 
 
 		 414 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.505533 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0341  DEAD/DEAH box helicase-like  28.71 
 
 		 529 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0103074  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  29.13 
 
 		 1069 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  29.13 
 
 		 1069 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  29.57 
 
 		 1901 aa  43.9  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.62 
 
 		 657 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000404908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1128  ATP-dependent DNA helicase RecQ  21.94 
 
 		 613 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438623  normal  0.28159 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  23.08 
 
 		 599 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.57 
 
 		 611 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.14 
 
 		 709 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  24.47 
 
 		 616 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.6085  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.02 
 
 		 543 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  22.35 
 
 		 714 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.02 
 
 		 543 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1318  ATP-dependent DNA helicase RecQ  22.14 
 
 		 419 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.227704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0137  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.03 
 
 		 631 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.837204  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3741  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  25.47 
 
 		 705 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158627  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1309  hypothetical protein  24 
 
 		 637 aa  43.9  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>