15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC00110 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC00110  fatty acid elongase, putative  100 
 
 
297 aa  605  9.999999999999999e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424466  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08117  fatty acid elongase (Gns1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02760)  52.11 
 
 
340 aa  269  4e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0234777 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34675  Fatty acyl-CoA elongase/Polyunsaturated fatty acid specific elongation enzyme  47.96 
 
 
336 aa  256  3e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.653716  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06435  conserved hypothetical protein  50.57 
 
 
299 aa  247  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_20287  predicted protein  57.53 
 
 
311 aa  211  1e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.0000000360095  normal  0.0368137 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33532  predicted protein  29.13 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.150608 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49867  predicted protein  26.69 
 
 
248 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668859  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20508  elongase delta 6 elongase  31.69 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0418317  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22274  delta 6 desaturase  34.62 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000806412  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34485  long chain acyl-coa elongase  32.28 
 
 
286 aa  67  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16376  predicted protein  31.47 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.982896  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80911  predicted protein  24.06 
 
 
350 aa  63.2  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176886  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00981  fatty acid elongase (Gig30), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16710)  32.61 
 
 
534 aa  55.8  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.80894  normal  0.789612 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9255  predicted protein  30.46 
 
 
278 aa  55.8  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0895405  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48622  predicted protein  25.97 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00534035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>