43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC00250 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC00250  hypothetical protein  100 
 
 		 1860 aa  3783    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.215441  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09471  DRAP deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13200)  28.57 
 
 		 222 aa  65.1  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33477  DRAP deaminase  27.33 
 
 		 585 aa  64.7  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.261571 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0169  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.86 
 
 		 360 aa  54.3  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1440  bifunctional diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase and 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  30.19 
 
 		 387 aa  53.5  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3397  riboflavin biosynthesis protein RibD  41.27 
 
 		 367 aa  53.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3096  riboflavin biosynthesis protein; diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  41.27 
 
 		 367 aa  52.8  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0152  riboflavin biosynthesis protein (diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase (riboflavin-specific deaminase) and 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase)  40.62 
 
 		 367 aa  52.8  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0112  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  30.48 
 
 		 361 aa  52.8  0.00007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3160  riboflavin biosynthesis protein RibD  33.33 
 
 		 384 aa  52  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.613531  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1211  riboflavin biosynthesis protein RibD  33.33 
 
 		 384 aa  52  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.558913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1162  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  33.33 
 
 		 381 aa  51.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2778  riboflavin biosynthesis protein RibD  33.33 
 
 		 384 aa  51.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.145947  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2571  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.81 
 
 		 162 aa  51.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000640841 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1096  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  33.33 
 
 		 381 aa  51.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.169182  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3469  riboflavin biosynthesis protein RibD  42.25 
 
 		 381 aa  51.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1096  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  33.33 
 
 		 381 aa  50.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0712601  normal  0.635027 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3303  riboflavin biosynthesis protein RibD  33.33 
 
 		 384 aa  50.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608141  hitchhiker  0.000809606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1311  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.4 
 
 		 372 aa  50.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.885852  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3159  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.48 
 
 		 384 aa  50.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021729  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14261  putative diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase and 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.38 
 
 		 368 aa  49.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2803  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.67 
 
 		 150 aa  49.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2093  riboflavin biosynthesis protein RibD  29.31 
 
 		 376 aa  48.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0587907  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2146  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.66 
 
 		 150 aa  48.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.756714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1900  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.66 
 
 		 150 aa  48.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.352549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0564  riboflavin biosynthesis protein RibD  24.22 
 
 		 371 aa  48.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1273  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  40.32 
 
 		 374 aa  48.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000865522  hitchhiker  0.000000025095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1722  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.39 
 
 		 162 aa  48.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544911  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0730  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.43 
 
 		 389 aa  47.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1596  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.03 
 
 		 367 aa  47.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1222  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  32.38 
 
 		 367 aa  47.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.22695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1861  riboflavin biosynthesis protein RibD  37.97 
 
 		 367 aa  47  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00806124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0020  riboflavin biosynthesis protein RibD  36.62 
 
 		 360 aa  47.4  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1359  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  25 
 
 		 364 aa  47.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1661  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  33.33 
 
 		 374 aa  47  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1187  riboflavin biosynthesis protein RibD  39.44 
 
 		 386 aa  46.2  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.379971  normal  0.943234 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1010  riboflavin biosynthesis protein RibD  40 
 
 		 377 aa  46.2  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1162  riboflavin biosynthesis protein RibD  40.32 
 
 		 373 aa  45.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00211394  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0498  riboflavin biosynthesis protein RibD  36.71 
 
 		 362 aa  45.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1908  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase, 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  29.27 
 
 		 364 aa  45.8  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1230  riboflavin biosynthesis protein RibD  37.84 
 
 		 360 aa  45.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0505  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.42 
 
 		 357 aa  45.4  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1260  riboflavin biosynthesis protein RibD  37.84 
 
 		 360 aa  45.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559672  hitchhiker  0.00689196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>