260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC00800 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC00800  biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase, putative  100 
 
 
789 aa  1614    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69676  biotin holocarboxylase synthetase  30.83 
 
 
675 aa  300  8e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06055  biotin apo-protein ligase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09550)  33.87 
 
 
713 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0305  biotin apo-protein ligase-related protein  36.2 
 
 
259 aa  108  5e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.568618  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119606  biotin holocarboxylase synthetase-like protein  26.33 
 
 
339 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0286  hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4499  biotin apo-protein ligase-related protein  30.64 
 
 
278 aa  77  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.616549  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1653  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.35 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00240  biotin--protein ligase  38.33 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002163  biotin-protein ligase/biotin operon repressor  35.83 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3227  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.77 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2717  biotin--protein ligase  34.81 
 
 
320 aa  67.4  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000120108  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03573  putative BirA bifunctional protein  28.1 
 
 
328 aa  67.4  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.184427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6247  biotin--protein ligase  28.51 
 
 
306 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2290  biotin--protein ligase  27.66 
 
 
306 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2904  biotin--protein ligase  27.66 
 
 
306 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.125895  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3757  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.2 
 
 
267 aa  63.9  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.450721 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2919  biotin--protein ligase  27.23 
 
 
306 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1765  putative biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.53 
 
 
225 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102539  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0775  transcriptional repressor of the biotin operon / biotin acetyl-CoA-carboxylase synthetase; RBL03563  27.85 
 
 
325 aa  63.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000728901  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04871  putative biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.53 
 
 
225 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.220847  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0032  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.57 
 
 
258 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19089  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0505  biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  28.36 
 
 
282 aa  62  0.00000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4716  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.9 
 
 
292 aa  61.6  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492677  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2816  biotin--protein ligase  26.81 
 
 
306 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.200473 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4072  biotin--protein ligase  28.86 
 
 
319 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0204  biotin--protein ligase  27.49 
 
 
319 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3003  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.68 
 
 
269 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1586  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.93 
 
 
289 aa  60.1  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4745  biotin--protein ligase  26.5 
 
 
333 aa  59.3  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.167382  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2953  biotin--protein ligase  26.81 
 
 
306 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3284  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.3 
 
 
268 aa  58.9  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.937339  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0180  biotin--protein ligase  28.19 
 
 
319 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0210584  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0132  biotin--protein ligase  25.76 
 
 
320 aa  58.9  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000234608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0184  biotin--protein ligase  28.19 
 
 
319 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570128  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  28.19 
 
 
319 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0851  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.78 
 
 
278 aa  58.5  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000131196  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0201  biotin--protein ligase  33.1 
 
 
319 aa  58.5  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0168  biotin--protein ligase  28.57 
 
 
320 aa  58.2  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00063361  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4229  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.52 
 
 
299 aa  58.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.45335 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0490  biotin--protein ligase  26.69 
 
 
297 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0887139 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0195  biotin--protein ligase  34.75 
 
 
319 aa  57.8  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0812  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.5 
 
 
336 aa  57.4  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0702  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.99 
 
 
319 aa  57  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0362526  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3965  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.86 
 
 
308 aa  57  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.89958  normal  0.0374002 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2876  biotin--protein ligase  29.93 
 
 
319 aa  56.2  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3775  biotin--protein ligase  26.85 
 
 
319 aa  56.6  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00231404  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0610  birA bifunctional protein  26.32 
 
 
319 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0984  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  25 
 
 
335 aa  56.6  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.381797 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3740  biotin--protein ligase  25.71 
 
 
319 aa  56.6  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00032759  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0566  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  25.87 
 
 
272 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1124  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.16 
 
 
231 aa  56.2  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0268  biotin--protein ligase  29.79 
 
 
320 aa  55.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0393829  hitchhiker  0.0050705 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2840  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.33 
 
 
328 aa  55.8  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4226  biotin--protein ligase  23.92 
 
 
305 aa  55.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0391  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.86 
 
 
240 aa  55.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1214  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.41 
 
 
241 aa  55.8  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3871  biotin--protein ligase  26.27 
 
 
319 aa  55.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000364778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0327  biotin--protein ligase  26.27 
 
 
319 aa  55.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0364706  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2932  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.44 
 
 
259 aa  55.5  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  25.6 
 
 
312 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664696 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3396  biotin--protein ligase  26.27 
 
 
319 aa  55.5  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3332  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.75 
 
 
269 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.591867 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1418  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.65 
 
 
274 aa  55.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1971  biotin-(acetyl-CoA carboxylase) holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  35.9 
 
 
327 aa  54.7  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4706  biotin--protein ligase  28.75 
 
 
320 aa  54.7  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144079  hitchhiker  0.00201782 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2871  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.57 
 
 
269 aa  54.7  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.336309  normal  0.418687 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3895  biotin--protein ligase  28.76 
 
 
319 aa  55.1  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.282712  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0700  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.39 
 
 
231 aa  55.1  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112932  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0219  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.21 
 
 
322 aa  55.1  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.440436  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0724  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.39 
 
 
231 aa  55.1  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.217665  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1887  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  24 
 
 
245 aa  54.7  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.595914  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1229  biotin--protein ligase  30.07 
 
 
317 aa  54.7  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4051  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.36 
 
 
272 aa  54.3  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.141913  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3315  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  25 
 
 
256 aa  54.3  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3908  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.61 
 
 
270 aa  54.3  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1071  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.71 
 
 
279 aa  54.3  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3351  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.3 
 
 
272 aa  54.3  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417142  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3943  biotin--protein ligase  30 
 
 
320 aa  54.3  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.596693  decreased coverage  0.000472258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2045  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.89 
 
 
267 aa  54.3  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4017  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.77 
 
 
321 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118949  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0214  biotin--protein ligase  27.21 
 
 
319 aa  53.5  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1967  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.8 
 
 
262 aa  53.9  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4404  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.2 
 
 
264 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03854  biotin-protein ligase  30.77 
 
 
321 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0188201  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4047  biotin--protein ligase  30.77 
 
 
321 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0641292  hitchhiker  0.00297103 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4564  biotin--protein ligase  28.47 
 
 
335 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3659  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.32 
 
 
272 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.834466  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0915  biotin--(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  24.35 
 
 
332 aa  53.5  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.277179  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4421  biotin--protein ligase  30.77 
 
 
321 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000434302  hitchhiker  0.00072275 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4207  biotin--protein ligase  30.77 
 
 
321 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000658318  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03807  hypothetical protein  30.77 
 
 
321 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3752  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  33.64 
 
 
326 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1200  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.71 
 
 
279 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0398  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32 
 
 
341 aa  53.5  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0778142  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1504  hypothetical protein  27.45 
 
 
270 aa  53.1  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5438  biotin--protein ligase  30.77 
 
 
321 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000183056  hitchhiker  0.00134266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4512  biotin--protein ligase  30.77 
 
 
321 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4461  biotin--protein ligase  30.77 
 
 
321 aa  53.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000740491  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1337  Biotin-protein ligase-like protein  30 
 
 
337 aa  53.1  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>