11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC00810 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC00810  gamma-tubulin complex component 3 (gcp-3), putative  100 
 
 
856 aa  1776    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04867  Gamma-tubulin complex protein 3 (Eurofung)  37.14 
 
 
968 aa  411  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.375952 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31283  predicted protein  28.89 
 
 
748 aa  311  5e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0962472  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44333  Spc98  28.12 
 
 
843 aa  169  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35149  predicted protein  24.14 
 
 
704 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721723  normal  0.0346434 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60226  spindle pole body component  21.8 
 
 
799 aa  125  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.112974  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47314  Spc97  22.63 
 
 
1274 aa  109  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.477788  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05873  Gamma-tubulin complex protein 2 (Eurofung)  22.56 
 
 
875 aa  102  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.748248  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02860  gamma-tubulin complex component 2 (gcp-2), putative  22.39 
 
 
909 aa  96.3  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.448332  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14999  predicted protein  23.2 
 
 
634 aa  69.3  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54133  predicted protein  20.17 
 
 
844 aa  48.9  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.510859  normal  0.869225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>