103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC00350 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  100 
 
 		 154 aa  311  2.9999999999999996e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  67.79 
 
 		 153 aa  191  4e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  62.77 
 
 		 139 aa  171  3.9999999999999995e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  56.41 
 
 		 121 aa  141  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  52.38 
 
 		 86 aa  90.9  6e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  51.16 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  50 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  50 
 
 		 86 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  50 
 
 		 86 aa  84.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  48.81 
 
 		 86 aa  84  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  46.15 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  42.5 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000249681  unclonable  0.000000335999 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  46.99 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  41.25 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  42.5 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  38.75 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  43.59 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  45.68 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  38.75 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  41.03 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  36.25 
 
 		 81 aa  63.5  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1776  ribosomal protein L23  47.44 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  43.24 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  40 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000262554  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  37.04 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  35.8 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  38.27 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  36.25 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000000299035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0003  50S ribosomal protein L23P  37.5 
 
 		 82 aa  50.8  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000337619  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0233  50S ribosomal protein L23  41.18 
 
 		 101 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0201  50S ribosomal protein L23  41.18 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000698801  unclonable  0.0000000000184888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0196  50S ribosomal protein L23  41.18 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000848979  decreased coverage  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0201  50S ribosomal protein L23  41.18 
 
 		 101 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000118285  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  40.54 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4168  50S ribosomal protein L23  41.18 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000463544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3757  50S ribosomal protein L23  41.18 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0198  50S ribosomal protein L23  41.18 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000795974  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0202  50S ribosomal protein L23  41.18 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000251497  unclonable  0.00000770372 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4054  50S ribosomal protein L23  41.18 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000001282  unclonable  0.00000000000566696 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  37.21 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  40.23 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0322  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00637694  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  32.5 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  44.83 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  43.86 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  38.46 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  44.93 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0215  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000957762  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  45.71 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  40.74 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  37.35 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  46.55 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  32.5 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  38.37 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  42.03 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1681  50S ribosomal protein L23  42.03 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0570438  hitchhiker  0.0000115816 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0172  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243767  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  45.31 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  43.08 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2172  50S ribosomal protein L23  37.65 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  33.72 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  33.72 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  33.72 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  33.72 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  42.42 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  33.72 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0150  50S ribosomal protein L23  40.24 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125205  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  33.7 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  33.72 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  42.03 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0228  50S ribosomal protein L23  34.09 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.194384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  33.72 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  33.72 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  33.72 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  33.72 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1617  Ribosomal protein L25/L23  38.33 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  40 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000423409  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  37.35 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3522  ribosomal protein L25/L23  37.93 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000457129  hitchhiker  0.00000622944 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0395  50S ribosomal protein L23  46.43 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  42.11 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  37.29 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  40.35 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0160  50S ribosomal protein L23  36.47 
 
 		 99 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000144621  decreased coverage  0.0000412321 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  43.1 
 
 		 95 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  43.86 
 
 		 93 aa  42.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2255  50S ribosomal protein L23  34.52 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000014312  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  30 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  36.25 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  36.25 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108369  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  36.25 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000248684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  36.84 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  36.84 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  42.19 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  42.19 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  34.72 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1718  50S ribosomal protein L23  35.37 
 
 		 98 aa  40.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0786377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>