More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1582 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  516  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  95.58 
 
 
250 aa  496  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  48.41 
 
 
253 aa  254  7e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
270 aa  157  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
253 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  33.74 
 
 
242 aa  148  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  36.64 
 
 
254 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  34.12 
 
 
254 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  36.47 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  36.86 
 
 
244 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  36.86 
 
 
243 aa  138  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  36.86 
 
 
243 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  36.86 
 
 
243 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  36.86 
 
 
243 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  34.88 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  36.86 
 
 
243 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  36.61 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  36.22 
 
 
243 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  33.86 
 
 
255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  30.71 
 
 
254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  30.86 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6769  transcriptional regulator, MerR family  37.89 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.220453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  34.63 
 
 
252 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
253 aa  123  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  29.6 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  32.67 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  27.76 
 
 
252 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  28.4 
 
 
254 aa  109  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
252 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  28 
 
 
253 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  29.62 
 
 
259 aa  105  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  26.58 
 
 
278 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  26.59 
 
 
253 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  27.49 
 
 
254 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  27.85 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  32.18 
 
 
253 aa  99  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  40.3 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
251 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  29.07 
 
 
252 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  27.63 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
251 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
251 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  46.3 
 
 
237 aa  92.4  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0217  transcriptional regulator, MerR family  28.68 
 
 
255 aa  92.4  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  27.78 
 
 
250 aa  89.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  26.69 
 
 
258 aa  89  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  44.79 
 
 
244 aa  89  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  25.31 
 
 
271 aa  87  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1826  MerR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
256 aa  86.7  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
268 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
288 aa  85.9  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  22.58 
 
 
274 aa  85.9  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  41 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  40.2 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0134  transcriptional regulator, MerR family  28.63 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0639  transcriptional regulator, MerR family  28.63 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  49.25 
 
 
253 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  54.41 
 
 
238 aa  78.2  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  50 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  37.66 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  37.66 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  38.18 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  40.51 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
377 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  32.09 
 
 
398 aa  72  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 
251 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0837  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  47.89 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1021  transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10693e-29 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  34.19 
 
 
429 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0829  MerR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  25.67 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1107  transcriptional regulator, MerR family  29.06 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  36.52 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  32.46 
 
 
395 aa  68.9  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  35.58 
 
 
347 aa  68.6  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  24.75 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0931  MerR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4916  multidrug-efflux transporter 1 regulator  49.18 
 
 
64 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  37.33 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>