More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1462 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1349  iron(III) ABC transporter, permease protein  99.81 
 
 
528 aa  1024    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.49 
 
 
525 aa  649    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.9 
 
 
527 aa  660    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2838  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  70.66 
 
 
531 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.62 
 
 
530 aa  714    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.17 
 
 
527 aa  706    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1462  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
528 aa  1028    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.95 
 
 
525 aa  637    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.905105  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2711  iron(III)-transport system permease  99.05 
 
 
528 aa  1017    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0924971  normal  0.0430816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.13 
 
 
526 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.865045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.73 
 
 
526 aa  591  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43356  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6135  ABC transporter membrane spanning protein  61.91 
 
 
513 aa  538  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.56 
 
 
536 aa  533  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.11 
 
 
526 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0924311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.11 
 
 
526 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.11 
 
 
526 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.73 
 
 
530 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.04 
 
 
536 aa  451  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145655  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.55 
 
 
533 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.97601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.5 
 
 
518 aa  424  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.543872  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.42 
 
 
509 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.992663  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.67 
 
 
500 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.35 
 
 
522 aa  373  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0398286  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.49 
 
 
534 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232577  normal  0.0312056 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1836  ABC Fe+3 transporter, inner membrane subunit  43.1 
 
 
534 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.374127  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 
521 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 
521 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3949  ABC Fe3+ transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
532 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305187  normal  0.0483056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 
521 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.24 
 
 
521 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.548778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.35 
 
 
503 aa  283  6.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0090372  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62010  putative iron ABC transporter, permease protein  41.2 
 
 
512 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0428593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0530  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.67 
 
 
521 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.162719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8129  iron ABC transporter, permease protein  38.99 
 
 
502 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.77 
 
 
511 aa  259  9e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269197  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06270  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  39.02 
 
 
515 aa  258  2e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0952696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
514 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923953  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
530 aa  252  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.63 
 
 
515 aa  251  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000100634  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.47 
 
 
523 aa  231  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 
511 aa  228  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.28 
 
 
536 aa  226  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
528 aa  210  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
530 aa  187  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.5168 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
541 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.63 
 
 
557 aa  180  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.54 
 
 
543 aa  179  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.24 
 
 
540 aa  161  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
506 aa  160  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
540 aa  160  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  32.85 
 
 
1057 aa  144  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.85 
 
 
530 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.442605 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  29.32 
 
 
553 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  22.75 
 
 
533 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00163  putative ABC-type transport system, permease component  32.9 
 
 
507 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.452019  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.8 
 
 
567 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  25.63 
 
 
564 aa  126  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.52 
 
 
550 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.714891  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.34 
 
 
561 aa  125  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  27.75 
 
 
538 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.05 
 
 
559 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.49 
 
 
540 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154251  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.98 
 
 
550 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.35 
 
 
563 aa  118  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.54 
 
 
556 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.21 
 
 
550 aa  117  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.15 
 
 
555 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.7 
 
 
540 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497984  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.92 
 
 
540 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.96 
 
 
549 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  28.78 
 
 
538 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.82 
 
 
538 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.82 
 
 
568 aa  111  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.09 
 
 
570 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0245  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.93 
 
 
538 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.37 
 
 
562 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
554 aa  108  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.52 
 
 
533 aa  107  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0400876  hitchhiker  0.00000113394 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.5 
 
 
557 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.406299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.4 
 
 
553 aa  106  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.445803 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.49 
 
 
558 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  26.62 
 
 
562 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.01 
 
 
562 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.26 
 
 
536 aa  102  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.556719  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0163  putative iron(III) ABC transporter, fused inner membrane subunits  27.2 
 
 
557 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0116  iron ABC transporter, permease protein  22.61 
 
 
518 aa  102  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.04 
 
 
570 aa  101  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.114886  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.44 
 
 
557 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2023  putative ABC transporter permease component  26.3 
 
 
559 aa  100  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967123  normal  0.0816083 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.32 
 
 
558 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.2 
 
 
562 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.2 
 
 
562 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193935  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.42 
 
 
562 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1525  ABC transporter, permease protein  24.15 
 
 
526 aa  98.2  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.23 
 
 
569 aa  98.2  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68890  putative iron ABC transporter, permease protein  27.64 
 
 
539 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.43 
 
 
566 aa  97.4  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.36 
 
 
558 aa  97.4  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.867638  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.93 
 
 
546 aa  97.4  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>