More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3521 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3521  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 428 aa  846    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.843712 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  66.44 
 
 		 435 aa  531  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  64.34 
 
 		 433 aa  521  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  61.81 
 
 		 440 aa  519  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  60.82 
 
 		 440 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  61.1 
 
 		 439 aa  506  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2919  homoserine dehydrogenase  63.68 
 
 		 438 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3264  homoserine dehydrogenase  62.61 
 
 		 440 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2783  homoserine dehydrogenase  62.95 
 
 		 441 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  61.63 
 
 		 436 aa  500  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  60.23 
 
 		 439 aa  500  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  58.29 
 
 		 441 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  60 
 
 		 439 aa  497  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2309  homoserine dehydrogenase  62.64 
 
 		 440 aa  494  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  58.29 
 
 		 441 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  59.03 
 
 		 440 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3996  homoserine dehydrogenase  62.1 
 
 		 439 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2698  homoserine dehydrogenase  62.39 
 
 		 440 aa  488  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1967  homoserine dehydrogenase  63.3 
 
 		 440 aa  489  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2243  homoserine dehydrogenase  63.07 
 
 		 440 aa  488  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1647  homoserine dehydrogenase  60.59 
 
 		 440 aa  481  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2495  homoserine dehydrogenase  60.82 
 
 		 439 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.35731  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2966  homoserine dehydrogenase  60.36 
 
 		 440 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1922  homoserine dehydrogenase  63.53 
 
 		 440 aa  477  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  55.29 
 
 		 430 aa  428  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  51.41 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2164  homoserine dehydrogenase  49.3 
 
 		 428 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0414769 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  49.3 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  49.65 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2998  homoserine dehydrogenase  49.06 
 
 		 428 aa  381  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.49984  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  51.51 
 
 		 437 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  48.6 
 
 		 438 aa  376  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0403  homoserine dehydrogenase  47.54 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4731  homoserine dehydrogenase  49.18 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0834  homoserine dehydrogenase  47.31 
 
 		 428 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.354577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2057  homoserine dehydrogenase  47.31 
 
 		 428 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0019  homoserine dehydrogenase  46.65 
 
 		 435 aa  348  8e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  44.14 
 
 		 439 aa  333  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  45.82 
 
 		 436 aa  333  4e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  44.39 
 
 		 439 aa  332  8e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  45.29 
 
 		 437 aa  332  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  45.29 
 
 		 437 aa  332  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  47.34 
 
 		 436 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  42.3 
 
 		 436 aa  323  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  44.16 
 
 		 440 aa  320  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  41.84 
 
 		 436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  46.14 
 
 		 436 aa  319  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  45.29 
 
 		 437 aa  319  5e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  41.15 
 
 		 436 aa  319  7e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  43.31 
 
 		 443 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  43.41 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  42.5 
 
 		 448 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  41.61 
 
 		 436 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  39.58 
 
 		 428 aa  317  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  41.84 
 
 		 436 aa  316  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  43.39 
 
 		 436 aa  315  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  44.05 
 
 		 436 aa  315  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  44.59 
 
 		 444 aa  315  9e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  46.36 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  42.18 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  42.92 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  43.54 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 		 420 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  41.71 
 
 		 433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  42.49 
 
 		 430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  42.4 
 
 		 440 aa  313  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  43.41 
 
 		 447 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  44.6 
 
 		 434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  43.64 
 
 		 442 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  43.09 
 
 		 435 aa  312  6.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  44.6 
 
 		 434 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  45.48 
 
 		 433 aa  312  6.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  44.29 
 
 		 434 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  44.29 
 
 		 434 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  44.29 
 
 		 434 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  43.41 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  43.41 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  42.3 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  44.37 
 
 		 437 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  45.26 
 
 		 432 aa  310  4e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  42.73 
 
 		 442 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  43.18 
 
 		 442 aa  308  8e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  40.87 
 
 		 438 aa  308  9e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  42.95 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  43.83 
 
 		 431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  43.35 
 
 		 434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  43.69 
 
 		 449 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  45.39 
 
 		 436 aa  306  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  43.81 
 
 		 434 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  43.49 
 
 		 427 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  41.93 
 
 		 436 aa  306  6e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  43.81 
 
 		 434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  44.5 
 
 		 439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  41.48 
 
 		 436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  44.39 
 
 		 463 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  41.59 
 
 		 440 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  42.66 
 
 		 431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  43.78 
 
 		 436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  44.27 
 
 		 439 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  40.89 
 
 		 432 aa  302  7.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>