More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3354 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3354  RNA methyltransferase  100 
 
 		 288 aa  568  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2203  RNA methyltransferase TrmH, group 3  69.39 
 
 		 273 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.524372  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3844  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  62.72 
 
 		 275 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5155  putative rRNA methylase  63.6 
 
 		 280 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.512859  normal  0.0887365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2508  RNA methyltransferase TrmH, group 3  62.72 
 
 		 283 aa  311  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3230  RNA methyltransferase TrmH, group 3  66.8 
 
 		 273 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2062  RNA methyltransferase TrmH, group 3  61.65 
 
 		 283 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0229052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3641  RNA methyltransferase TrmH, group 3  68.72 
 
 		 275 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179566  normal  0.181036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2905  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  67.54 
 
 		 268 aa  288  7e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4216  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  64.32 
 
 		 259 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1027  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  64.16 
 
 		 269 aa  259  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.335988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0183  RNA methyltransferase  62.39 
 
 		 268 aa  258  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0125  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  62.82 
 
 		 268 aa  257  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  0.365569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1559  RNA methyltransferase  63.25 
 
 		 281 aa  255  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12965  normal  0.228384 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1084  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  57.72 
 
 		 276 aa  245  6.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1939  RNA methyltransferase  54.07 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1810  tRNA/rRNA metyltransferase  54.58 
 
 		 293 aa  242  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1254  RNA methyltransferase  52.33 
 
 		 286 aa  242  5e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159804  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1314  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  57.2 
 
 		 296 aa  242  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1216  RNA methyltransferase  52.33 
 
 		 303 aa  242  6e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1412  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  57.58 
 
 		 296 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908439  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0360  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  55.9 
 
 		 293 aa  235  7e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0968  RNA methyltransferase  52.99 
 
 		 291 aa  232  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0219055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1336  RNA methyltransferase  49.28 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.875783 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0558  RNA methyltransferase  52.17 
 
 		 276 aa  225  7e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162254  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2721  RNA methyltransferase  48.87 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334114  normal  0.254549 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0082  RNA methyltransferase  49.33 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2255  RNA methyltransferase  46.72 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0110995  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2049  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.31 
 
 		 262 aa  172  7.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2239  tRNA/rRNA metyltransferase  45.26 
 
 		 261 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.695793  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0914  RNA methyltransferase  45.26 
 
 		 261 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106416 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2757  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  49.78 
 
 		 321 aa  168  9e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.611419 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3826  RNA methyltransferase  45.56 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2426  RNA methyltransferase  45.05 
 
 		 247 aa  165  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2703  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.98 
 
 		 348 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.224688  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1364  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.75 
 
 		 271 aa  162  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84942  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2801  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.87 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2571  RNA methyltransferase  42.86 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.387243  hitchhiker  0.000000145169 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0846  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.3 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.139402  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0262  RNA methyltransferase  37.93 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295307  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1606  RNA methyltransferase  37.37 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15011  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1625  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.84 
 
 		 251 aa  149  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.117052  hitchhiker  0.00235214 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0851  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.74 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.367945  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1817  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.6 
 
 		 289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.503004 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1523  RNA methyltransferase  39.34 
 
 		 247 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2518  RNA methyltransferase  39.75 
 
 		 247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00110794  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1685  RNA methyltransferase  39.34 
 
 		 247 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4689  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.93 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196854  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1067  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.93 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1547  RNA methyltransferase  38.93 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.844862  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0951  RNA methyltransferase  35.19 
 
 		 254 aa  143  4e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1469  RNA methyltransferase  38.52 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1448  RNA methyltransferase  38.52 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1971  RNA methyltransferase  39.34 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  46.02 
 
 		 349 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.988579  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1746  RNA methyltransferase  39.34 
 
 		 247 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248108  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1262  RNA methyltransferase  39.34 
 
 		 247 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1799  RNA methyltransferase  39.34 
 
 		 247 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.335408  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1817  RNA methyltransferase  39.34 
 
 		 247 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1020  RNA methyltransferase  39.34 
 
 		 247 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0199854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0146  RNA methyltransferase  39.34 
 
 		 247 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1165  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.56 
 
 		 250 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1937  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.51 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.177305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1073  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.56 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09121  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.89 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.19 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0404  RNA methyltransferase  33.19 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.106461  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1903  RNA methyltransferase  39.29 
 
 		 244 aa  139  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0247051 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1708  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.34 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.9 
 
 		 248 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531626  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2268  RNA methyltransferase  38.71 
 
 		 248 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144304  normal  0.908224 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09101  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.61 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1817  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  38.52 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392601  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1229  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  38.14 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00902362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3029  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.57 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.068461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2539  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.11 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0797344  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1606  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.31 
 
 		 248 aa  136  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  38.59 
 
 		 245 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2176  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.11 
 
 		 247 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000213076  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.76 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1890  RNA methyltransferase  35.97 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.575059 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3018  RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 250 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0609  RNA methyltransferase TrmH  36.4 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0802048 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1696  RNA methyltransferase  38.52 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0995  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.64 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1408  RNA methyltransferase  32.92 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0243869  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0615  RNA methyl transferase TrmH, group 3  32.76 
 
 		 252 aa  132  6e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2767  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.08 
 
 		 247 aa  132  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2232  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.47 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3418  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.39 
 
 		 246 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125093  normal  0.287966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.18 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0684  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  44.25 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  hitchhiker  0.000276778 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3934  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  44.25 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.62 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3263  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  44.25 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000357773  hitchhiker  0.0000120778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3414  RNA methyltransferase  42.78 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.377337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4032  RNA methyltransferase  43.5 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104893  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0262  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.96 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1061  23S rRNA Gm2251 methyltransferase  34.45 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3377  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.26 
 
 		 251 aa  130  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>