More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4456 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4456  ABC transporter related  100 
 
 		 319 aa  636    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  78.95 
 
 		 305 aa  482  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  78.95 
 
 		 305 aa  480  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  81.54 
 
 		 343 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  77.44 
 
 		 309 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  74.67 
 
 		 325 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  74.83 
 
 		 319 aa  454  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0826  putative ATP-binding ABC transporter protein  74.35 
 
 		 334 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  71.99 
 
 		 315 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  73.77 
 
 		 325 aa  449  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  74.42 
 
 		 319 aa  450  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  61.44 
 
 		 310 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  61.44 
 
 		 310 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  63.4 
 
 		 316 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  63.12 
 
 		 316 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  61.76 
 
 		 321 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  61.76 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  60.86 
 
 		 308 aa  359  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  60.86 
 
 		 308 aa  359  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  60.86 
 
 		 308 aa  359  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  62.25 
 
 		 321 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  61.18 
 
 		 308 aa  358  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  61.44 
 
 		 308 aa  358  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  61.76 
 
 		 308 aa  358  9e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  61.51 
 
 		 336 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  60.13 
 
 		 297 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  61.76 
 
 		 308 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  61.76 
 
 		 308 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  62.58 
 
 		 321 aa  354  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  61.18 
 
 		 313 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  61.18 
 
 		 308 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  61.28 
 
 		 302 aa  353  2e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  61.18 
 
 		 313 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  61.18 
 
 		 313 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  60.84 
 
 		 308 aa  352  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  60.78 
 
 		 308 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  60.74 
 
 		 298 aa  350  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  57.43 
 
 		 309 aa  348  6e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  72.65 
 
 		 250 aa  338  9e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3396  ABC transporter related  70.94 
 
 		 239 aa  335  7e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  54.28 
 
 		 306 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  54.28 
 
 		 306 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0984  ABC transporter related  49.18 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  47.65 
 
 		 326 aa  269  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  48.55 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  48 
 
 		 307 aa  268  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  46.86 
 
 		 319 aa  262  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  47.88 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  47.73 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  47.25 
 
 		 309 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  47.57 
 
 		 309 aa  258  8e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  44.27 
 
 		 320 aa  256  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  45.15 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  45.28 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  43 
 
 		 318 aa  249  6e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  44.52 
 
 		 312 aa  245  9e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  44.95 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  43.23 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  43.4 
 
 		 304 aa  239  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  45.8 
 
 		 333 aa  236  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  43 
 
 		 329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  42.81 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1331  ABC transporter related  42.23 
 
 		 340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  42.81 
 
 		 306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  41.69 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  42.81 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  46.69 
 
 		 320 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  42.38 
 
 		 308 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2135  ABC transporter related protein  40.51 
 
 		 355 aa  229  7e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  41.06 
 
 		 308 aa  228  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2327  ABC transporter related  43.04 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  48.36 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  41.83 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  40.58 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  40.66 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  40 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  39.02 
 
 		 304 aa  227  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  47.95 
 
 		 315 aa  227  3e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  42.35 
 
 		 309 aa  227  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  40.07 
 
 		 308 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  40.33 
 
 		 308 aa  225  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2089  ABC transporter related  42.58 
 
 		 308 aa  225  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116539  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  41.91 
 
 		 310 aa  225  9e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5107  ABC transporter related  41.74 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  40.45 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  40.33 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  41.16 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  42.35 
 
 		 333 aa  223  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  42.21 
 
 		 318 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  44.86 
 
 		 316 aa  222  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  38.85 
 
 		 319 aa  222  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5174  ABC transporter related  41.64 
 
 		 314 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0541  ABC transporter, ATPase subunit  41.27 
 
 		 314 aa  221  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  40.33 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  40 
 
 		 306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  40.98 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  39.87 
 
 		 315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  40.26 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>