272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0619 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  100 
 
 
336 aa  686    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  91.45 
 
 
339 aa  629  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  34.82 
 
 
346 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  29.71 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.83 
 
 
342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.08 
 
 
344 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.73 
 
 
336 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.91 
 
 
345 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  27.78 
 
 
674 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  28.98 
 
 
329 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29 
 
 
331 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  31.38 
 
 
348 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  29.67 
 
 
342 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  32.74 
 
 
354 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  30.25 
 
 
328 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3959  NMT1/THI5 like domain protein  26.33 
 
 
344 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  29.02 
 
 
357 aa  98.6  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2129  hypothetical protein  28.79 
 
 
341 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  24.89 
 
 
338 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1395  NMT1/THI5 like domain-containing protein  24.9 
 
 
339 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.311199 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0392  twin-arginine translocation pathway signal  25.93 
 
 
352 aa  96.7  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00263227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.25 
 
 
335 aa  95.9  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1136  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28 
 
 
351 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2975  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.69 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.459543  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  26.61 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1093  twin-arginine translocation pathway signal  26.56 
 
 
346 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0955  hypothetical protein  28.69 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3969  NMT1/THI5 like domain protein  26.48 
 
 
346 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 
915 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1084  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  26.1 
 
 
340 aa  93.2  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1461  hypothetical protein  27.92 
 
 
314 aa  92.8  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3607  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.18 
 
 
351 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1522  hypothetical protein  27.92 
 
 
314 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  26.6 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.15 
 
 
330 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2599  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  25.85 
 
 
335 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1097  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.15 
 
 
362 aa  90.5  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.93236 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0940  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  25.42 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.2 
 
 
342 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  25.31 
 
 
355 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.27 
 
 
323 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  27.24 
 
 
331 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1138  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.07 
 
 
345 aa  86.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.847412  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.57 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.2 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  25.38 
 
 
856 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  25.95 
 
 
686 aa  84  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.96 
 
 
341 aa  84  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  27.59 
 
 
360 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1941  NMT1/THI5 family protein  25 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000780337 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.67 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  29.46 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.94 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.2 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.94 
 
 
332 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.96 
 
 
339 aa  82  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  27.2 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  26.2 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.2 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.2 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  26.78 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  24.43 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.2 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.44 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  25.42 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  26.57 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  26.57 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  26.57 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.57 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  26.57 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.2 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.57 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  26.2 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  25.83 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  26.2 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.89 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.83 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  28.03 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3737  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  25.65 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457967  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  25 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6053  NMT1/THI5 like domain protein  26.32 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2680  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  26.39 
 
 
353 aa  79.3  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.03 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  27.03 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  28.63 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.63 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7652  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  24.79 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422947  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.47 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  29.52 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4595  NMT1/THI5 like domain protein  24.37 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  25.75 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  30.35 
 
 
336 aa  77  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3125  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.49 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.37 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  24.46 
 
 
1065 aa  76.3  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  21.4 
 
 
593 aa  75.9  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.16 
 
 
329 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  24.91 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.83 
 
 
1238 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.71 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>