More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0406 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0406  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  762    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  51.06 
 
 		 323 aa  356  5e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  45.17 
 
 		 334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  43.59 
 
 		 312 aa  293  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  44.02 
 
 		 337 aa  245  9e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.7 
 
 		 345 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.7 
 
 		 345 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  43.96 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  39.1 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.49 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.91 
 
 		 331 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  43.46 
 
 		 334 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  43.91 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.47 
 
 		 330 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  44.44 
 
 		 330 aa  225  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  43.98 
 
 		 344 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  40.28 
 
 		 698 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  39.49 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  42.86 
 
 		 339 aa  224  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  42.16 
 
 		 334 aa  224  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  40.53 
 
 		 341 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  39.24 
 
 		 331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.13 
 
 		 325 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.75 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4551  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  42.08 
 
 		 684 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  40.93 
 
 		 356 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.42 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  38.83 
 
 		 329 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  40.36 
 
 		 320 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  44.53 
 
 		 328 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  39.63 
 
 		 339 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  42.59 
 
 		 325 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  38.69 
 
 		 341 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.5 
 
 		 336 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  41.22 
 
 		 328 aa  215  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0217  hypothetical protein  41.12 
 
 		 387 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  39.29 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  36.34 
 
 		 339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.3 
 
 		 328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  35.21 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  39.85 
 
 		 324 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  40.15 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.78 
 
 		 327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.25 
 
 		 336 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  37.86 
 
 		 321 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  41.92 
 
 		 325 aa  213  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  34.38 
 
 		 321 aa  212  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.77 
 
 		 330 aa  212  9e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40.08 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  38.7 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  39.64 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  39.44 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.38 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  40.29 
 
 		 341 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  40.38 
 
 		 317 aa  210  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3805  hypothetical protein  43.53 
 
 		 707 aa  210  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.245031  normal  0.613822 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  40.38 
 
 		 320 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  40.67 
 
 		 330 aa  210  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  39.8 
 
 		 334 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  38.81 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  37.87 
 
 		 337 aa  209  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3530  hypothetical protein  43.35 
 
 		 321 aa  209  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0974  hypothetical protein  36.36 
 
 		 324 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.013055 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  41.89 
 
 		 356 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  35.23 
 
 		 338 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  39.08 
 
 		 335 aa  209  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  40.38 
 
 		 317 aa  209  8e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  37.69 
 
 		 324 aa  208  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  41.5 
 
 		 337 aa  209  9e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3799  hypothetical protein  41.92 
 
 		 329 aa  209  9e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  38.3 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  39.77 
 
 		 327 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  37.75 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  31.9 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  35.17 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  39.92 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  42.75 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  37.82 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  37.4 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  39.54 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  38.89 
 
 		 332 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  37.91 
 
 		 326 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  39.54 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.29 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  37.41 
 
 		 353 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  39.54 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4275  extra-cytoplasmic solute receptor  42.64 
 
 		 341 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  37.93 
 
 		 328 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  39.84 
 
 		 335 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  37.99 
 
 		 321 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  41.52 
 
 		 326 aa  206  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.93 
 
 		 326 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.72 
 
 		 325 aa  206  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.72 
 
 		 327 aa  206  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  33.33 
 
 		 341 aa  206  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  38.72 
 
 		 330 aa  206  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 		 331 aa  205  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.27 
 
 		 328 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.46 
 
 		 339 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  39.08 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>