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for query gene Vapar_4381 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 209 aa  423  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  65.37 
 
 		 201 aa  275  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  64.04 
 
 		 203 aa  272  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  60.29 
 
 		 210 aa  265  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  60.29 
 
 		 209 aa  263  8.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  64.42 
 
 		 207 aa  261  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  61.35 
 
 		 204 aa  258  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  65.54 
 
 		 187 aa  251  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  60.59 
 
 		 206 aa  246  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  62.77 
 
 		 198 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  60.56 
 
 		 205 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  57.29 
 
 		 205 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  57.81 
 
 		 205 aa  218  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  57.75 
 
 		 196 aa  217  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  58.29 
 
 		 194 aa  216  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  58.76 
 
 		 231 aa  215  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  55.5 
 
 		 205 aa  215  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  55.5 
 
 		 205 aa  215  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  55.5 
 
 		 205 aa  215  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  55.5 
 
 		 205 aa  215  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  55.5 
 
 		 205 aa  215  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  57.22 
 
 		 205 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  56.98 
 
 		 181 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  56.98 
 
 		 181 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  57.54 
 
 		 181 aa  209  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  57.22 
 
 		 205 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  56.63 
 
 		 205 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  56.63 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  57.98 
 
 		 191 aa  207  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  58.76 
 
 		 205 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  56.19 
 
 		 205 aa  205  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  57.14 
 
 		 204 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  56.82 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  52.27 
 
 		 197 aa  200  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  53.98 
 
 		 203 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  53.41 
 
 		 203 aa  197  9e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  52.66 
 
 		 221 aa  195  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  49.72 
 
 		 201 aa  193  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  52.38 
 
 		 211 aa  191  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  47.64 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  46.78 
 
 		 197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  48 
 
 		 264 aa  178  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  44.25 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  43.55 
 
 		 191 aa  155  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  42.86 
 
 		 201 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  40.85 
 
 		 188 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  45.45 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  45.45 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  45.45 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  47.13 
 
 		 202 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  41.71 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  45.83 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  39.04 
 
 		 197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  43.83 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  40.11 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  44.17 
 
 		 213 aa  138  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  34.68 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0378  SCO1/SenC family protein  34.68 
 
 		 197 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  39.49 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  39.88 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 198 aa  131  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  38.76 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  45.93 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  35.84 
 
 		 200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  35.84 
 
 		 200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  43.17 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  40.46 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  37.82 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  42.34 
 
 		 203 aa  125  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  33.15 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  33.15 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  40.25 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  43.18 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  34.27 
 
 		 226 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  34.83 
 
 		 275 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  34.27 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  34.27 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  34.27 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  39.49 
 
 		 211 aa  121  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  45.04 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  45.04 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  41.18 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  40.91 
 
 		 199 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  35.03 
 
 		 197 aa  118  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  36.16 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  45.04 
 
 		 196 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  45.38 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  44.09 
 
 		 197 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  36.77 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3333  electron transport protein SCO1/SenC  36.63 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 198 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
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NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  33.53 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  38.75 
 
 		 218 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  36.6 
 
 		 200 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
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NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  37.66 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  37.43 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
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NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  39.39 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  37.82 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
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NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  38.64 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
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