200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4316 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  59.79 
 
 		 692 aa  695    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  100 
 
 		 672 aa  1314    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  37.36 
 
 		 698 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  37.92 
 
 		 697 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  42.31 
 
 		 680 aa  375  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  36.75 
 
 		 691 aa  353  8e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  39.04 
 
 		 679 aa  353  8.999999999999999e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  35.19 
 
 		 659 aa  340  5.9999999999999996e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.43 
 
 		 670 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  40.4 
 
 		 679 aa  334  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.06 
 
 		 688 aa  317  5e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  36.53 
 
 		 718 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  38.74 
 
 		 680 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  34.29 
 
 		 702 aa  310  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.72 
 
 		 700 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  37.32 
 
 		 687 aa  308  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  33.68 
 
 		 695 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  35.65 
 
 		 695 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  35.65 
 
 		 700 aa  306  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  33.33 
 
 		 695 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  35.18 
 
 		 713 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  33.43 
 
 		 695 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  36.67 
 
 		 719 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6657  fusaric acid resistance protein region  38.38 
 
 		 707 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5813  fusaric acid resistance protein region  38.38 
 
 		 707 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6177  fusaric acid resistance protein region  38.38 
 
 		 707 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3170  fusaric acid resistance protein region  34.96 
 
 		 716 aa  301  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.841968 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  38.05 
 
 		 710 aa  300  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  32.71 
 
 		 697 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6148  fusaric acid resistance protein region  37.33 
 
 		 710 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.623711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  33.68 
 
 		 681 aa  292  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  34.13 
 
 		 688 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  33.28 
 
 		 704 aa  291  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0110  fusaric acid resistance protein, putative  33.63 
 
 		 749 aa  287  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  32 
 
 		 687 aa  287  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  33.28 
 
 		 695 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  36.35 
 
 		 639 aa  282  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  35.24 
 
 		 682 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.94 
 
 		 653 aa  281  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2406  fusaric acid resistance protein region  37.33 
 
 		 690 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  32.46 
 
 		 713 aa  246  6.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4098  efflux transporter  32.99 
 
 		 693 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870113  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  44.36 
 
 		 625 aa  203  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  30.46 
 
 		 676 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  30.56 
 
 		 726 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  27.49 
 
 		 724 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  26.48 
 
 		 727 aa  148  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  26.7 
 
 		 731 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  25.89 
 
 		 725 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  27.12 
 
 		 724 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  28.71 
 
 		 662 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  25.84 
 
 		 725 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  25.52 
 
 		 725 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  25.84 
 
 		 725 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.89 
 
 		 733 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  28.37 
 
 		 711 aa  144  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  26.52 
 
 		 732 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  25.22 
 
 		 744 aa  140  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  26.24 
 
 		 733 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.24 
 
 		 733 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  29.1 
 
 		 662 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  26.24 
 
 		 733 aa  140  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  26.24 
 
 		 733 aa  140  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  26.24 
 
 		 733 aa  140  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  26.24 
 
 		 733 aa  140  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  26.24 
 
 		 733 aa  140  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  29.03 
 
 		 673 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  29.03 
 
 		 673 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  29.03 
 
 		 673 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  28.3 
 
 		 662 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  45.86 
 
 		 664 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  26.95 
 
 		 729 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  26.26 
 
 		 728 aa  137  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  24.01 
 
 		 670 aa  136  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  24.96 
 
 		 655 aa  135  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.53 
 
 		 655 aa  135  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.53 
 
 		 655 aa  135  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  44.59 
 
 		 664 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  24.96 
 
 		 655 aa  135  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.53 
 
 		 655 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.53 
 
 		 655 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.53 
 
 		 655 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.53 
 
 		 655 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  26.43 
 
 		 734 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.38 
 
 		 655 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  25.37 
 
 		 733 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  24.87 
 
 		 736 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  27.57 
 
 		 691 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  25.21 
 
 		 733 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  29.19 
 
 		 676 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  28.67 
 
 		 676 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  34.54 
 
 		 730 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  26.15 
 
 		 699 aa  129  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  25.32 
 
 		 731 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  26.02 
 
 		 734 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  25.04 
 
 		 731 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4042  fusaric acid resistance protein region  26.37 
 
 		 727 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4324  fusaric acid resistance protein region  26.37 
 
 		 727 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  28.03 
 
 		 725 aa  123  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  25.86 
 
 		 734 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>