More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1487 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1487  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 267 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4081  alpha/beta hydrolase fold  35.62 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 284 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  29.6 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  31.84 
 
 		 324 aa  82  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  27.76 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2755  hypothetical protein  32.52 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0392069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  39.69 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2766  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.77 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  32.64 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4087  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  28.69 
 
 		 556 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.779957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  41.96 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  37.8 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.67 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  31.68 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.68 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  43.75 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 		 303 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  41.38 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  40.82 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.09 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  32.66 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  32.91 
 
 		 494 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  31.99 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  34.13 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  27.44 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  23.29 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  23.29 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  24.51 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  23.29 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  30.65 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  29.96 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  29.2 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  23.29 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  23.29 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.9 
 
 		 346 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  30.74 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  36.44 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  38.79 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  30.35 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.89 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  22.62 
 
 		 562 aa  65.5  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  41.75 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  37.17 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.07 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  22.95 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  22.6 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  30.65 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  22.53 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  30.73 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  30.34 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  28.36 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  32.17 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  24.71 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.33 
 
 		 639 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.14 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  28.15 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  38.94 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  43 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  22.6 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  22.6 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>