More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1337 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 487 aa  986    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  58.6 
 
 		 477 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 478 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.76 
 
 		 480 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.55 
 
 		 492 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 469 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  42.27 
 
 		 483 aa  396  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 483 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 473 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 473 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  42.25 
 
 		 473 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.15 
 
 		 475 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  42.74 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 479 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 477 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  42.14 
 
 		 477 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 475 aa  359  5e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  40.94 
 
 		 500 aa  359  6e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 532 aa  358  8e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 471 aa  358  8e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  41.93 
 
 		 477 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  41.93 
 
 		 477 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  38.66 
 
 		 479 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 487 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 479 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  39.57 
 
 		 493 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 477 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.29 
 
 		 484 aa  357  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 475 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 473 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 472 aa  356  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2521  aminotransferase  39.95 
 
 		 433 aa  355  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3795  regulatory protein GntR HTH  37.55 
 
 		 471 aa  355  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2231  GntR family transcriptional regulator  39.95 
 
 		 433 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 479 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.91 
 
 		 479 aa  354  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 471 aa  354  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 476 aa  353  4e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  39.37 
 
 		 473 aa  353  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 473 aa  352  8e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 473 aa  352  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 478 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 473 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  39.16 
 
 		 473 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 470 aa  351  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  41.81 
 
 		 483 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  40.39 
 
 		 479 aa  350  4e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.22 
 
 		 470 aa  349  6e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 482 aa  349  7e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 470 aa  348  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 481 aa  348  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 477 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.41 
 
 		 477 aa  347  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 477 aa  347  4e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  37.98 
 
 		 475 aa  346  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  39.96 
 
 		 479 aa  345  7e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3396  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 473 aa  345  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  44.87 
 
 		 482 aa  344  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 491 aa  344  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.39 
 
 		 479 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 509 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 478 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  38.66 
 
 		 480 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 530 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  38.74 
 
 		 472 aa  343  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  38.23 
 
 		 480 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 469 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 471 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0750  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.8 
 
 		 472 aa  339  5e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0724533  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1471  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.21 
 
 		 472 aa  339  5e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.0159158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  42.92 
 
 		 481 aa  340  5e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2701  GntR family transcriptional regulator  39.03 
 
 		 502 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193287  normal  0.0380236 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  38.53 
 
 		 474 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  38.53 
 
 		 474 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  38.53 
 
 		 474 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  38.53 
 
 		 474 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4810  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.06 
 
 		 474 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0244404  hitchhiker  0.0000000000137556 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  38.53 
 
 		 474 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1932  GntR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 476 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00018992  normal  0.474146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0076  transcriptional regulator  38.99 
 
 		 488 aa  336  5.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0336  GntR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 478 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.87 
 
 		 475 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.61 
 
 		 471 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2175  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.91 
 
 		 498 aa  335  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0145  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 472 aa  334  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0157  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 477 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00565529  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  40.13 
 
 		 469 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.95 
 
 		 483 aa  332  8e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  38.15 
 
 		 476 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1067  GntR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 478 aa  331  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315299  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  39.96 
 
 		 492 aa  330  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 469 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 469 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 474 aa  329  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>