87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0638 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0638  putative phage recombinase  100 
 
 		 305 aa  627  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0874979  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1674  phage integrase family protein  28.77 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7902  integrase family protein  27.34 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356547  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8481  integrase family protein  26.99 
 
 		 353 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383754  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6128  integrase family protein  25.33 
 
 		 353 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5646  integrase family protein  25.44 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1883  site-specific recombinase XerD-like  25.51 
 
 		 649 aa  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0237  phage integrase family protein  25.41 
 
 		 331 aa  86.7  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2995  integrase family protein  25.36 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.941848  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4377  phage integrase family protein  25.45 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.53808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2304  phage integrase  24.17 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327568  normal  0.0181167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0918  integrase family protein  25.36 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4157  integrase domain-containing protein  24.46 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  24.68 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02045  Site-specific recombinase XerD-like protein  29.47 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.317068  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0008  DNA integration/recombination/inversion protein  24.22 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.856285  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2276  integrase family protein  25.87 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00370914  hitchhiker  0.000967634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3359  integrase family protein  24.79 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  24.43 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  24.19 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  24.19 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1382  Phage integrase  24.14 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4680  integrase family protein  20.34 
 
 		 346 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2976  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  24.11 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0607408  normal  0.0219571 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6146  integrase family protein  21.69 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6972  integrase family protein  22.47 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0164563  normal  0.0336098 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1553  putative integrase/recombinase  23.04 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4524  phage integrase family protein  27.19 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3041  cointegrase  24.02 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2033  phage integrase family protein  24.46 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1698  Phage integrase  21.4 
 
 		 328 aa  57  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3058  cointegrate resolution protein S  24.25 
 
 		 323 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3968  phage integrase family protein  21.96 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3109  cointegrate resolution protein S  23.32 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00637573  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35820  cointegrate resolution protein S  24.25 
 
 		 323 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000225241  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2105  integrase family protein  22.22 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2392  integrase family protein  22.22 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530338  normal  0.472164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2511  phage integrase  21.43 
 
 		 448 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6280  integrase family protein  21.13 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1908  phage integrase family protein  21.09 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454202  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2384  phage integrase family site specific recombinase  25.71 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1943  phage integrase family protein  26.05 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171548  normal  0.0940691 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1996  phage integrase family protein  26.05 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2480  integrase family protein  23.29 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4316  phage integrase family protein  19.38 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2981  Tn4652, cointegrate resolution protein S  23.22 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0457753 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2244  phage integrase family protein  23.83 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.111867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2094  integrase family protein  23.18 
 
 		 400 aa  53.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000349759  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02951  Phage integrase  21.74 
 
 		 336 aa  52.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2926  Phage integrase  23.58 
 
 		 312 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2249  phage integrase family protein  20.91 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2263  phage integrase family protein  26.34 
 
 		 371 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00650578  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3434  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  20.29 
 
 		 375 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3277  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  20.29 
 
 		 375 aa  51.2  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2382  integrase family protein  24.31 
 
 		 354 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0941885  normal  0.501513 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2082  integrase family protein  25.85 
 
 		 371 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.024543  hitchhiker  0.000210845 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1987  phage integrase family protein  23.26 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3751  integrase family protein  22.93 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2380  phage integrase family protein  23.93 
 
 		 371 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.032696 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4195  phage integrase  20.73 
 
 		 408 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0564405  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2092  phage integrase family protein  25.96 
 
 		 406 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4239  hypothetical protein  22.04 
 
 		 365 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0653636  normal  0.519885 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1640  integrase family protein  20.6 
 
 		 320 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5281  integrase family protein  20.6 
 
 		 320 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4027  integrase family protein  23.08 
 
 		 372 aa  49.7  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4820  phage integrase family protein  20.97 
 
 		 356 aa  49.3  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4579  phage integrase  21.21 
 
 		 406 aa  49.3  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.18624  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4358  phage integrase  20 
 
 		 408 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8006  integrase protein  20 
 
 		 378 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7008  phage integrase family protein  19.71 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2752  integrase domain protein SAM domain protein  20.67 
 
 		 362 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00014768  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5342  putative cointegrate resolution protein S / recombinase  21.03 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4367  phage integrase family protein  21.78 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2185  integrase family protein  26.26 
 
 		 413 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0291516  hitchhiker  0.00000847111 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25710  cointegrate resolution protein S  20.39 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1962  AP endonuclease  20 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5150  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  20.47 
 
 		 399 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0046  putative integrase  24.54 
 
 		 189 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  26.21 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9008  phage integrase family protein  19.85 
 
 		 377 aa  46.6  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6161  integrase family protein  25.55 
 
 		 382 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.365462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  25.98 
 
 		 316 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00624  cointegrase  20 
 
 		 322 aa  46.2  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.281729  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4516  phage integrase  25.22 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  22.61 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4576  phage integrase  19.26 
 
 		 357 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4716  phage integrase family protein  25.41 
 
 		 379 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>