More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0445 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0445  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 266 aa  543  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05952  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  69.92 
 
 		 272 aa  400  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000216  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  69.43 
 
 		 272 aa  397  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.909844  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0202  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  75.92 
 
 		 278 aa  397  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.55601  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3959  extracellular solute-binding protein  49.15 
 
 		 276 aa  259  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3070  extracellular solute-binding protein  49.36 
 
 		 273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.966648  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2597  extracellular solute-binding protein family 3  44.87 
 
 		 270 aa  241  9e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189611  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  47.66 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  42.75 
 
 		 278 aa  236  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2287  extracellular solute-binding protein  44.12 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  35.56 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  33.09 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  35.68 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  30.6 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  34.41 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  33.47 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  29.85 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  31.7 
 
 		 273 aa  123  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5074  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5024  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.57 
 
 		 266 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  32.16 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  32.38 
 
 		 273 aa  122  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  31.76 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  31.76 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  31.76 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  31.76 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  32.94 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  31.76 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  32.43 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  32.55 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  32.55 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  32.55 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  32.55 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  31.76 
 
 		 266 aa  119  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  31.76 
 
 		 266 aa  118  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1651  cyclohexadienyl dehydratase precursor  27.73 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  32.05 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  31.37 
 
 		 265 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  34.92 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  34.92 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  34.92 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  33.89 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  31.35 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1835  extracellular solute-binding protein family 3  30.96 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0545252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  37.23 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.89 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3333  extracellular solute-binding protein  31.18 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  30.27 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  32.91 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  32.31 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  35.76 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0236  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  32.07 
 
 		 271 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  32.07 
 
 		 271 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  32.07 
 
 		 271 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  39.02 
 
 		 246 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  38.65 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  32.07 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  29.39 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  35.15 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  35.15 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  29.12 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0017  extracellular solute-binding protein  30.21 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.141798 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  30 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19140  cyclohexadienyl dehydratase precursor  26.89 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4123  cyclohexadienyl dehydratase  28.19 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0829887  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.65 
 
 		 271 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  30 
 
 		 284 aa  99.4  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 284 aa  99.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  29.12 
 
 		 278 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  31.22 
 
 		 271 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2512  putative cyclohexadienyl dehydratase precursor signal peptide protein  26.56 
 
 		 267 aa  98.6  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.204589  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 		 266 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 266 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 		 266 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 266 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  31.22 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  31.22 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  29.36 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  31.22 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.22 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.22 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  31.22 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.74 
 
 		 266 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2961  cyclohexadienyl dehydratase  25.48 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  32.64 
 
 		 268 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  32.64 
 
 		 268 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1151  prephenate dehydratase  24.11 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  30 
 
 		 295 aa  95.5  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  30 
 
 		 295 aa  95.5  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 268 aa  95.5  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  34.91 
 
 		 271 aa  95.5  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>