More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0417 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0417  putative sensor kinase protein  100 
 
 		 391 aa  808    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3010  histidine kinase A domain-containing protein  60.98 
 
 		 420 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.728657  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001594  two-component system sensor protein  57.55 
 
 		 413 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000479105  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05571  sensory transduction protein kinase  57.29 
 
 		 413 aa  454  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0334  histidine kinase  57.66 
 
 		 418 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000559138  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4638  sensor histidine kinase  52.84 
 
 		 430 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2061  putative two-component sensor  28.48 
 
 		 431 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02793  histidine kinase  28.47 
 
 		 426 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3318  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 420 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  23.35 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24340  putative two-component sensor  28 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  25.85 
 
 		 455 aa  99.4  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2810  histidine kinase  27.88 
 
 		 425 aa  97.1  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003061  two-component system sensor protein  29.67 
 
 		 429 aa  96.3  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.69 
 
 		 423 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  23.96 
 
 		 405 aa  94.4  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2297  Signal transduction histidine kinase-like  23.6 
 
 		 446 aa  94  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247505  hitchhiker  0.000082991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2523  sensor histidine kinase  25.98 
 
 		 435 aa  93.2  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.311676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 422 aa  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353371 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2374  sensor histidine kinase  25.45 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171494  normal  0.151024 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 		 418 aa  90.1  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1866  sensor histidine kinase  27.04 
 
 		 421 aa  89.7  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  25.45 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4497  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4485  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 436 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2642  sensor histidine kinase  26.46 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.244154  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 447 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0941  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 436 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2833  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.643319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.48 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0970  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1973  histidine kinase  23.88 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.73664 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3631  histidine kinase  25 
 
 		 449 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000017519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 455 aa  83.2  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0147  signal transduction histidine kinase-like protein  25.76 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  26.55 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4195  histidine kinase A domain-containing protein  27.19 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4327  histidine kinase A domain-containing protein  26.73 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  23.08 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597631 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4622  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3797  ATPase domain-containing protein  27.19 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2252  histidine kinase  23.9 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56940  putative two-component sensor  26.44 
 
 		 426 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339832  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0692  histidine kinase A domain-containing protein  26.91 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04467  two-component system (histidine kinase) sensor protein requried for AvrXa21 activity H (raxH)  24.64 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.73 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3576  histidine kinase A domain-containing protein  25.91 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4373  sensor histidine kinase ColS  24.39 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4069  sensor histidine kinase  25.15 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00769633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  25.21 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0719  sensor histidine kinase  26.61 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.420092 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1163  Signal transduction histidine kinase sensor  24.07 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2130  histidine kinase  21.96 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4951  putative two-component sensor  25.44 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17790  sensory histidine protein kinase, two-component, ColS  27.78 
 
 		 421 aa  67  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0988  sensor histidine kinase ArlS  29.73 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101467  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1046  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.34 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3015  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 470 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2713  histidine kinase  28.17 
 
 		 470 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1243  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6963  histidine kinase  23.68 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.20821  normal  0.0498309 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2105  two-component system, sensor protein  25.1 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 596 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4554  histidine kinase  23.96 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00930403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.79 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0159551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4883  histidine kinase  28.35 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.876275 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1188  sensor histidine kinase, putative  27.38 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2055  sensor histidine kinase  27.04 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.91 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1930  histidine kinase  24.17 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.824341  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2731  twp-component sensor histidine kinase  26.36 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 595 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2585  histidine kinase  23.81 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  decreased coverage  0.00983118 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.03 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2539  histidine kinase A domain protein  23.68 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  25.28 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2038  ATP-binding region ATPase domain protein  28.47 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.65 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1333  histidine kinase A domain protein  23.39 
 
 		 412 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0512  histidine kinase  23.83 
 
 		 489 aa  57  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  23.78 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4006  histidine kinase A domain-containing protein  27.04 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0731  histidine kinase  23.4 
 
 		 563 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.842876  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3007  histidine kinase  26.77 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18640  sensory histidine protein kinase,two-component  25.1 
 
 		 472 aa  56.2  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 686 aa  56.2  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0140  sensor histidine kinase  26.73 
 
 		 471 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 		 608 aa  55.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.63 
 
 		 488 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  22.26 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  23.88 
 
 		 438 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 		 1273 aa  55.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  23.88 
 
 		 438 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  24.73 
 
 		 463 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>