More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2666 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01822  phosphogluconate dehydratase  55.91 
 
 		 603 aa  675    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1790  6-phosphogluconate dehydratase  55.91 
 
 		 603 aa  675    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00020158  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1943  phosphogluconate dehydratase  55.74 
 
 		 603 aa  674    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2081  phosphogluconate dehydratase  55.91 
 
 		 603 aa  675    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1336  phosphogluconate dehydratase  55.91 
 
 		 603 aa  675    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2487  phosphogluconate dehydratase  55.67 
 
 		 608 aa  675    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00512  phosphogluconate dehydratase  79.93 
 
 		 598 aa  1021    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4499  phosphogluconate dehydratase  54.49 
 
 		 604 aa  655    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1868  phosphogluconate dehydratase  55.52 
 
 		 613 aa  668    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2771  phosphogluconate dehydratase  54.64 
 
 		 611 aa  644    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.683921  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3746  phosphogluconate dehydratase  53.49 
 
 		 618 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2723  phosphogluconate dehydratase  53.49 
 
 		 618 aa  648    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4214  phosphogluconate dehydratase  53.26 
 
 		 608 aa  635    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0796  phosphogluconate dehydratase  51.84 
 
 		 605 aa  638    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0627  phosphogluconate dehydratase  53.82 
 
 		 618 aa  643    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1227  phosphogluconate dehydratase  64.42 
 
 		 601 aa  807    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1239  phosphogluconate dehydratase  55.74 
 
 		 603 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0667  phosphogluconate dehydratase  70.69 
 
 		 599 aa  909    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.345393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2586  phosphogluconate dehydratase  55.91 
 
 		 603 aa  675    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27280  phosphogluconate dehydratase  53.91 
 
 		 608 aa  647    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2333  phosphogluconate dehydratase  55.17 
 
 		 608 aa  669    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.480587  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2077  phosphogluconate dehydratase  54.83 
 
 		 608 aa  667    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2537  phosphogluconate dehydratase  55.17 
 
 		 608 aa  665    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.449195 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2666  phosphogluconate dehydratase  100 
 
 		 598 aa  1237    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001960  phosphogluconate dehydratase  81.1 
 
 		 598 aa  1026    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2126  phosphogluconate dehydratase  55.74 
 
 		 603 aa  672    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0177  phosphogluconate dehydratase  53.65 
 
 		 618 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0972  phosphogluconate dehydratase  53.17 
 
 		 607 aa  643    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.798865  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0157  phosphogluconate dehydratase  53.12 
 
 		 604 aa  639    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2046  phosphogluconate dehydratase  55.18 
 
 		 608 aa  665    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.26142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2044  phosphogluconate dehydratase  55 
 
 		 608 aa  670    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.747422  normal  0.183886 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1931  phosphogluconate dehydratase  55.17 
 
 		 608 aa  671    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0231353  normal  0.168183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2420  phosphogluconate dehydratase  54.73 
 
 		 603 aa  665    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.72923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1894  phosphogluconate dehydratase  53.33 
 
 		 608 aa  650    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0555  phosphogluconate dehydratase  54.15 
 
 		 618 aa  648    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782141  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2132  phosphogluconate dehydratase  55.35 
 
 		 608 aa  669    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0124289  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0660  phosphogluconate dehydratase  53.65 
 
 		 618 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2072  phosphogluconate dehydratase  55.18 
 
 		 608 aa  665    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.013535  normal  0.010914 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0581  phosphogluconate dehydratase  54.15 
 
 		 618 aa  648    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.600403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2149  phosphogluconate dehydratase  55.17 
 
 		 608 aa  672    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00662337  normal  0.165329 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1781  phosphogluconate dehydratase  55.57 
 
 		 603 aa  673    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183249 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2252  phosphogluconate dehydratase  55.18 
 
 		 608 aa  667    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000737054  hitchhiker  0.00000261809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2044  phosphogluconate dehydratase  55.74 
 
 		 603 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.809483 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1810  phosphogluconate dehydratase  55.17 
 
 		 608 aa  662    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.965283  normal  0.98697 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01810  hypothetical protein  55.91 
 
 		 603 aa  675    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4525  phosphogluconate dehydratase  55.35 
 
 		 608 aa  670    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2099  phosphogluconate dehydratase  55.74 
 
 		 603 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1363  phosphogluconate dehydratase  55.74 
 
 		 603 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.015599  hitchhiker  0.000000974102 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2177  phosphogluconate dehydratase  55.35 
 
 		 608 aa  670    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.318983  hitchhiker  0.00331575 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01246  phosphogluconate dehydratase  53.83 
 
 		 608 aa  647    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.106151  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2239  phosphogluconate dehydratase  55.35 
 
 		 608 aa  670    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0583467  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2039  phosphogluconate dehydratase  55.74 
 
 		 603 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1010  phosphogluconate dehydratase  52.75 
 
 		 608 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.765635  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1288  6-phosphogluconate dehydratase  52.84 
 
 		 608 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1109  phosphogluconate dehydratase  52.84 
 
 		 608 aa  634  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1476  phosphogluconate dehydratase  52.5 
 
 		 623 aa  633  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4375  phosphogluconate dehydratase  53.18 
 
 		 608 aa  633  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1791  phosphogluconate dehydratase  52.5 
 
 		 623 aa  633  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.563758 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1080  phosphogluconate dehydratase  52.68 
 
 		 604 aa  634  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00217258  hitchhiker  0.0000000267621 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1048  phosphogluconate dehydratase  52.75 
 
 		 608 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1009  phosphogluconate dehydratase  52.75 
 
 		 608 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.241046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1582  phosphogluconate dehydratase  52.76 
 
 		 618 aa  630  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.197578  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1312  phosphogluconate dehydratase  52.92 
 
 		 607 aa  629  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.19652  normal  0.978584 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0466  phosphogluconate dehydratase  52.15 
 
 		 604 aa  629  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3442  phosphogluconate dehydratase  52.5 
 
 		 617 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0393  phosphogluconate dehydratase  51.5 
 
 		 607 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.602731  normal  0.354196 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1217  phosphogluconate dehydratase  52.49 
 
 		 617 aa  626  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.890922  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0361  phosphogluconate dehydratase  51.74 
 
 		 607 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.181973 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2446  phosphogluconate dehydratase  52.5 
 
 		 617 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0485  phosphogluconate dehydratase  51.75 
 
 		 612 aa  623  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0461  phosphogluconate dehydratase  51.92 
 
 		 612 aa  622  1e-177  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3407  phosphogluconate dehydratase  52.5 
 
 		 617 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.491528  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0759  phosphogluconate dehydratase  53.6 
 
 		 624 aa  622  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0364344 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2632  phosphogluconate dehydratase  52.5 
 
 		 617 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414199  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1221  phosphogluconate dehydratase  52.5 
 
 		 617 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22910  phosphogluconate dehydratase  52.26 
 
 		 608 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.404341 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3442  phosphogluconate dehydratase  52.5 
 
 		 617 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1934  phosphogluconate dehydratase  52.26 
 
 		 608 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.976581  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0363  phosphogluconate dehydratase  52.5 
 
 		 617 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4741  6-phosphogluconate dehydratase  53.43 
 
 		 616 aa  621  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2283  phosphogluconate dehydratase  51.18 
 
 		 604 aa  621  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.348239  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1018  phosphogluconate dehydratase  52.33 
 
 		 619 aa  618  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1081  phosphogluconate dehydratase  53.24 
 
 		 623 aa  620  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.685711  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5330  phosphogluconate dehydratase  51.75 
 
 		 611 aa  620  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.388356  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1381  phosphogluconate dehydratase  51.33 
 
 		 609 aa  620  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2640  phosphogluconate dehydratase  53.11 
 
 		 618 aa  620  1e-176  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1698  phosphogluconate dehydratase  52.33 
 
 		 617 aa  618  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.390811  hitchhiker  0.0000236515 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1830  phosphogluconate dehydratase  53.41 
 
 		 606 aa  619  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.511602  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1560  phosphogluconate dehydratase  51.34 
 
 		 609 aa  615  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0589  phosphogluconate dehydratase  52.59 
 
 		 634 aa  615  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0936  phosphogluconate dehydratase  52.59 
 
 		 623 aa  616  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5802  phosphogluconate dehydratase  51.75 
 
 		 700 aa  615  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.446982 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1440  phosphogluconate dehydratase  52.09 
 
 		 608 aa  618  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3958  phosphogluconate dehydratase  51.75 
 
 		 607 aa  616  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4868  phosphogluconate dehydratase  51.67 
 
 		 612 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.192986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3551  phosphogluconate dehydratase  51.17 
 
 		 605 aa  612  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.952112  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3791  phosphogluconate dehydratase  51.67 
 
 		 612 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7067  phosphogluconate dehydratase  51.25 
 
 		 610 aa  610  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1045  phosphogluconate dehydratase  53.1 
 
 		 629 aa  611  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00269183  normal  0.140285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2049  phosphogluconate dehydratase  51.58 
 
 		 605 aa  608  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0575852  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>