More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0967 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  100 
 
 
385 aa  788    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  37.97 
 
 
374 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  37.7 
 
 
374 aa  237  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  37.4 
 
 
409 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  37.5 
 
 
413 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  38.86 
 
 
383 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  35.66 
 
 
394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  38.78 
 
 
383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  36.14 
 
 
413 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  37.43 
 
 
405 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  37.78 
 
 
383 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  36.93 
 
 
409 aa  210  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  35.71 
 
 
372 aa  204  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  35.95 
 
 
372 aa  200  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  35.36 
 
 
376 aa  199  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  36.09 
 
 
378 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  32.09 
 
 
376 aa  196  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  35.95 
 
 
389 aa  196  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  33.6 
 
 
391 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  34.55 
 
 
388 aa  186  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  35.75 
 
 
376 aa  186  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  37.15 
 
 
377 aa  185  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  32.62 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  32.62 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  32.97 
 
 
408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  36.02 
 
 
407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  35.75 
 
 
382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  36.02 
 
 
382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  35.75 
 
 
382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  35.4 
 
 
407 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  35.38 
 
 
388 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  36 
 
 
382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  37.42 
 
 
420 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  34.43 
 
 
394 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  32.52 
 
 
432 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  33.15 
 
 
376 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  33.06 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  32.7 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  32.15 
 
 
376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  32.28 
 
 
438 aa  172  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  33.24 
 
 
376 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.99 
 
 
358 aa  170  4e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.99 
 
 
358 aa  170  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  33.33 
 
 
381 aa  170  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  32.8 
 
 
372 aa  170  4e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  35.88 
 
 
412 aa  169  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  31.54 
 
 
429 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  29.79 
 
 
410 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  31.28 
 
 
415 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  33.24 
 
 
412 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  33.51 
 
 
409 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  30.89 
 
 
376 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  31.93 
 
 
436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  33.33 
 
 
375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  31.65 
 
 
436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  31.55 
 
 
385 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  32.69 
 
 
385 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  31.22 
 
 
436 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  33.33 
 
 
405 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  33.07 
 
 
401 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  31.59 
 
 
416 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  31.56 
 
 
387 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  31 
 
 
363 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  32.61 
 
 
376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  33.42 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  31.61 
 
 
417 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  33.6 
 
 
367 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  29.6 
 
 
423 aa  146  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  29.17 
 
 
428 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  34.21 
 
 
391 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  29.08 
 
 
418 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  31.2 
 
 
402 aa  142  7e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  29.63 
 
 
424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  32.08 
 
 
376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  30 
 
 
418 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  29.41 
 
 
422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  27.85 
 
 
432 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  29.43 
 
 
424 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0238  peptidase M20  29.32 
 
 
436 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489939  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  29.19 
 
 
441 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  24.34 
 
 
743 aa  102  8e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0219  peptidase dimerization domain protein  31.86 
 
 
384 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176401  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  27.39 
 
 
434 aa  97.4  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  26.38 
 
 
377 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  30.38 
 
 
375 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  26.54 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  27.79 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  25.64 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2568  peptidase T-like protein  28.85 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00779474  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  26.2 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  28.01 
 
 
368 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.91 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  26.35 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.73 
 
 
381 aa  77  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  27.84 
 
 
417 aa  76.3  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  29.44 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  26.61 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.03 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  25.9 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  25.23 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>