More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0988 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  96.35 
 
 		 384 aa  769    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  100 
 
 		 384 aa  788    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0097  aminotransferase class V  52.27 
 
 		 377 aa  411  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  47.77 
 
 		 384 aa  339  4e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  47.37 
 
 		 384 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  46.54 
 
 		 394 aa  336  5e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  44.15 
 
 		 392 aa  330  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  47.61 
 
 		 382 aa  328  9e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  44.95 
 
 		 391 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  44.03 
 
 		 396 aa  324  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  44.88 
 
 		 400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  44.53 
 
 		 404 aa  320  3e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  43.09 
 
 		 396 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  44.59 
 
 		 383 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  45.09 
 
 		 396 aa  318  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  44.41 
 
 		 389 aa  316  6e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  43.35 
 
 		 391 aa  315  7e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  43.19 
 
 		 392 aa  315  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  43.77 
 
 		 398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  43.77 
 
 		 398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  43.62 
 
 		 389 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  44.15 
 
 		 389 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  43.95 
 
 		 398 aa  311  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  42.59 
 
 		 388 aa  309  5e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1064  aminotransferase, class V  42.82 
 
 		 387 aa  309  6.999999999999999e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  42.37 
 
 		 382 aa  308  9e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  42.89 
 
 		 394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  43.75 
 
 		 400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  45.12 
 
 		 402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  43.88 
 
 		 400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  42.97 
 
 		 382 aa  305  7e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  42.02 
 
 		 384 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  42.29 
 
 		 404 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  42.11 
 
 		 399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  42.74 
 
 		 414 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  42.11 
 
 		 381 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1331  aminotransferase, class V  42.05 
 
 		 380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1273  cysteine desulfhydrase  42.05 
 
 		 380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000190468  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  42.93 
 
 		 398 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  41.58 
 
 		 398 aa  302  6.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  43.16 
 
 		 417 aa  301  9e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  42.11 
 
 		 381 aa  301  9e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.89 
 
 		 400 aa  301  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  42.44 
 
 		 398 aa  301  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  40.99 
 
 		 502 aa  300  3e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  43.2 
 
 		 396 aa  300  3e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  40.85 
 
 		 402 aa  300  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  42.97 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  42.59 
 
 		 388 aa  299  6e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  42.02 
 
 		 391 aa  299  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  42.18 
 
 		 403 aa  298  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1547  aminotransferase class V  41.38 
 
 		 382 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  42.78 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1163  NifS family cysteine desulfurase  41.36 
 
 		 396 aa  297  2e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  41.69 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  42.18 
 
 		 393 aa  296  3e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  40.8 
 
 		 393 aa  296  4e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  40.96 
 
 		 393 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  41.22 
 
 		 407 aa  296  6e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  41.95 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  42.04 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.16 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  42.13 
 
 		 1139 aa  293  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  42.51 
 
 		 383 aa  293  5e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2008  aminotransferase, class V  41.58 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.475663  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  40.94 
 
 		 493 aa  291  1e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  40.96 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  43.01 
 
 		 402 aa  289  7e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  42.08 
 
 		 1143 aa  288  9e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  40.27 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  41.6 
 
 		 409 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  43.09 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  41.58 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  41.64 
 
 		 388 aa  287  2e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  40.79 
 
 		 379 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1684  aminotransferase class V  39.43 
 
 		 387 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2190  Cysteine desulfurase  42.2 
 
 		 406 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.980213  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  41.88 
 
 		 402 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1770  NifS family cysteine desulfurase  40.84 
 
 		 396 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.406981  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.32 
 
 		 404 aa  286  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  41.82 
 
 		 403 aa  286  5.999999999999999e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  42.97 
 
 		 397 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  45.65 
 
 		 392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  40.79 
 
 		 507 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  41.83 
 
 		 380 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  40.96 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0042  NifS family cysteine desulfurase  40.58 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  42.33 
 
 		 397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0534  pyridoxal-phosphate dependent aminotransferase  40.37 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.08 
 
 		 388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  41.49 
 
 		 402 aa  283  4.0000000000000003e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  41.76 
 
 		 380 aa  281  9e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  42.33 
 
 		 383 aa  282  9e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  41.64 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  40.79 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  41.64 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  41.38 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  42.01 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4479  aminotransferase class V  41.6 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  40.99 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>