More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0169 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 445 aa  912    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.26 
 
 		 433 aa  222  8e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2122  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.4 
 
 		 409 aa  209  7e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000158093  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0996  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.8 
 
 		 427 aa  209  8e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.100891 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0313  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.66 
 
 		 428 aa  199  6e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.95 
 
 		 426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0402  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.09 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.77 
 
 		 448 aa  177  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1808  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.84 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39064  normal  0.563323 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.78 
 
 		 452 aa  144  4e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.79 
 
 		 457 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.66 
 
 		 435 aa  106  9e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.6 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.76 
 
 		 435 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.38 
 
 		 445 aa  103  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.91 
 
 		 435 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0553  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.6 
 
 		 437 aa  95.5  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.64 
 
 		 453 aa  93.6  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.56 
 
 		 458 aa  92  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0044  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.79 
 
 		 442 aa  90.5  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.24 
 
 		 430 aa  90.5  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  26.58 
 
 		 449 aa  90.5  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.99 
 
 		 450 aa  90.1  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.207758  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.87 
 
 		 445 aa  89.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.64 
 
 		 474 aa  89.7  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.38 
 
 		 444 aa  89  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.11 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  27.67 
 
 		 460 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  26.58 
 
 		 449 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.44 
 
 		 445 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.1 
 
 		 458 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.69 
 
 		 441 aa  87.4  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  29.39 
 
 		 459 aa  86.7  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.89 
 
 		 462 aa  86.7  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0847  microcin-processing peptidase 1  29.75 
 
 		 448 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0776  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.03 
 
 		 437 aa  86.3  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.58521  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1482  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.89 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528913  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  27.6 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0267  peptidase PmbA  28.15 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.11 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.83 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0572  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.16 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.11 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.78 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0426  peptidase PmbA  29.06 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.31 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0490  peptidase PmbA  29.06 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.61 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.46 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.45 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_002936  DET0526  pmbA/tldD family protein  24.32 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0275  peptidase PmbA  27.81 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0978  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.5 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0215485  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.39 
 
 		 465 aa  83.2  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1169  peptidase PmbA  29.06 
 
 		 446 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0355671 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  32 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0779  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.33 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0416  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.91 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  26.2 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4551  pmbA protein  25.3 
 
 		 453 aa  81.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  26.57 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.13 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0502  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.5 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.350832  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.65 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.46 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  27.39 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  32.29 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.27 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.57 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  26.27 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  26.27 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  26.57 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  26.27 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.87 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  26.27 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  26.27 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.44 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  26.27 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.44 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0865  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.05 
 
 		 448 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.619374  normal  0.968432 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.89 
 
 		 458 aa  79.7  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4388  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.3 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_467  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.67 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4727  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.86 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.03 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5086  putative modulator of DNA gyrase  31.41 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0071  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.8 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.208063  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  31.77 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  25.34 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  31.77 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  31.77 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  31.77 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.35 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3821  peptidase PmbA  30.89 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  27.08 
 
 		 448 aa  76.6  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.08 
 
 		 448 aa  76.6  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4463  pmbA protein  27.08 
 
 		 448 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0853906  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58050  PmbA protein  30.89 
 
 		 449 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0170866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1274  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.7 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.277535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0911  microcin-processing peptidase 1  27.3 
 
 		 460 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>