103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2837 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2837  amine oxidase  100 
 
 		 448 aa  891    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3587  amine oxidase  30 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  23.52 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  27.44 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  26.69 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  23.18 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1544  amine oxidase  25.09 
 
 		 504 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268529 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  24.79 
 
 		 531 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  22.97 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  23.65 
 
 		 628 aa  57  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  27.53 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  24.79 
 
 		 492 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  29.01 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  33.2 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  28.75 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  24.73 
 
 		 469 aa  53.9  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  37.66 
 
 		 466 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  37.66 
 
 		 466 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  29.75 
 
 		 421 aa  53.9  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  23.88 
 
 		 471 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  27.11 
 
 		 459 aa  53.1  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  25.58 
 
 		 450 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  25.58 
 
 		 450 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  28.03 
 
 		 465 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  21.79 
 
 		 484 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0250  hypothetical protein  30.2 
 
 		 562 aa  52.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  20.88 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5265  amine oxidase  36.78 
 
 		 543 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  28.57 
 
 		 444 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  27.7 
 
 		 493 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  22.95 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  21.57 
 
 		 524 aa  50.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  24.15 
 
 		 507 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  22.13 
 
 		 495 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  27.05 
 
 		 449 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4081  amine oxidase  35.71 
 
 		 571 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.39239 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  27.55 
 
 		 469 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  23.98 
 
 		 479 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1239  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0355742  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  29.07 
 
 		 520 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  26.64 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  21.5 
 
 		 495 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  22.78 
 
 		 459 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  38.2 
 
 		 455 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  24.66 
 
 		 532 aa  47  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  27.03 
 
 		 427 aa  47  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  22.08 
 
 		 473 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  25.57 
 
 		 426 aa  47  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  24.89 
 
 		 469 aa  47  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0811  phytoene dehydrogenase  38.98 
 
 		 523 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0324739  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  41.67 
 
 		 537 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  45.65 
 
 		 487 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  45.65 
 
 		 487 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  26.35 
 
 		 438 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  39.44 
 
 		 491 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  23.61 
 
 		 520 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  36.71 
 
 		 527 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  28.87 
 
 		 490 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  37 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1802  amine oxidase  25.27 
 
 		 439 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000252839  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  30 
 
 		 532 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  45.65 
 
 		 490 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  21.99 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  38.18 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  43.48 
 
 		 490 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  43.48 
 
 		 482 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  43.48 
 
 		 485 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  43.48 
 
 		 482 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  43.48 
 
 		 482 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 494 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  25.16 
 
 		 439 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  21.6 
 
 		 459 aa  44.7  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  28.12 
 
 		 494 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  43.48 
 
 		 490 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  43.48 
 
 		 487 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  28.12 
 
 		 578 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  29 
 
 		 467 aa  44.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_715  FAD dependent oxidoreductase  37.29 
 
 		 500 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  26.81 
 
 		 454 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  32.39 
 
 		 482 aa  44.3  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  22.01 
 
 		 436 aa  44.3  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  37.68 
 
 		 436 aa  43.9  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01816  hypothetical protein  23.84 
 
 		 436 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  28.08 
 
 		 498 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  28.08 
 
 		 498 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  33.87 
 
 		 509 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  26.13 
 
 		 447 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  37.1 
 
 		 509 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0731  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  39.68 
 
 		 500 aa  43.9  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.444322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0218  amine oxidase  28.57 
 
 		 399 aa  43.9  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1312  amine oxidase  23.3 
 
 		 416 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  50 
 
 		 557 aa  43.9  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  35.44 
 
 		 527 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  37.29 
 
 		 502 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  25.68 
 
 		 413 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  37.1 
 
 		 478 aa  43.5  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  35.48 
 
 		 509 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  26.41 
 
 		 474 aa  43.5  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  46.34 
 
 		 353 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  42.62 
 
 		 530 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>