More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1989 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1989  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 229 aa  444  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  53.49 
 
 		 221 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0637  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.15 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.38 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.65 
 
 		 201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  51.92 
 
 		 213 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.73 
 
 		 234 aa  178  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.44 
 
 		 221 aa  178  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 212 aa  178  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  47.62 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.05 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.91 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.65 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  41.56 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 219 aa  171  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.7 
 
 		 220 aa  172  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 209 aa  171  7.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 219 aa  171  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.29 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 216 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.4 
 
 		 247 aa  170  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.24 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 218 aa  169  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.7 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.61 
 
 		 212 aa  169  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.41 
 
 		 227 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.73 
 
 		 230 aa  167  9e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  43.24 
 
 		 223 aa  167  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  44.86 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  44.81 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  44.8 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.11 
 
 		 226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  44.34 
 
 		 216 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.39 
 
 		 221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  42.72 
 
 		 218 aa  164  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 226 aa  164  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  43.87 
 
 		 217 aa  164  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  44.24 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.45 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  43.06 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.36 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.19 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.98 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.75 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.71 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.05 
 
 		 241 aa  162  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.01 
 
 		 218 aa  161  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.19 
 
 		 221 aa  161  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.44 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 254 aa  159  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.8 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.91 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.46 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3846  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 249 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.525033  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  43.32 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  44.95 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.44 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.79 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.27 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6211  response regulator receiver protein  40.27 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.36 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.95 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6529  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.87 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  0.114568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.98 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7606  response regulator receiver protein  45.41 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  40.47 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 232 aa  159  5e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  41.4 
 
 		 215 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.8 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.24 
 
 		 211 aa  158  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.00104431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  43.66 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  42.59 
 
 		 221 aa  158  8e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 220 aa  158  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 234 aa  158  8e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0541  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 221 aa  158  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  41.86 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  40.85 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02970  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.66 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.611463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  41.1 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  41.98 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 222 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.67 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>