112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1088 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  100 
 
 		 418 aa  864    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  68.69 
 
 		 440 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  63.96 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.645092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  62.68 
 
 		 418 aa  544  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1359  fatty acid desaturase  61.96 
 
 		 413 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1377  fatty acid desaturase  61.96 
 
 		 413 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  61.81 
 
 		 413 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  64.89 
 
 		 415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  60.64 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  60.7 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  62.95 
 
 		 400 aa  488  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1090  fatty acid desaturase  55.82 
 
 		 428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263257  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  55.07 
 
 		 400 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  52.04 
 
 		 401 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  52.86 
 
 		 368 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  52.86 
 
 		 368 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  52.86 
 
 		 368 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  50.65 
 
 		 382 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  52.16 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  52.16 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  52.43 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  51.78 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  51.24 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4480  fatty acid desaturase  51.21 
 
 		 409 aa  383  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  50.81 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  50.54 
 
 		 380 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  50 
 
 		 391 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  48.89 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  50.82 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2220  fatty acid desaturase  49.86 
 
 		 380 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  50.7 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  49.72 
 
 		 360 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5061  fatty acid desaturase  48.08 
 
 		 408 aa  362  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.287786  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  48.88 
 
 		 378 aa  359  5e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  47.03 
 
 		 390 aa  354  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  49.17 
 
 		 397 aa  353  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23250  fatty acid desaturase  48.19 
 
 		 452 aa  352  8.999999999999999e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.183691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  47.31 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  48.06 
 
 		 369 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  48.06 
 
 		 369 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  48.1 
 
 		 400 aa  345  8e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  47.31 
 
 		 377 aa  345  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  46.51 
 
 		 380 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  43.03 
 
 		 464 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  47.69 
 
 		 760 aa  338  9e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  45.89 
 
 		 356 aa  330  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3767  fatty acid desaturase  44.32 
 
 		 384 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000585865  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2268  fatty acid desaturase  40.1 
 
 		 464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2315  fatty acid desaturase  40.1 
 
 		 464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2307  fatty acid desaturase  40.1 
 
 		 464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  45.56 
 
 		 373 aa  323  5e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  41.69 
 
 		 357 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  43.04 
 
 		 382 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  46.48 
 
 		 370 aa  299  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  47.03 
 
 		 360 aa  296  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  46.2 
 
 		 362 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  40.33 
 
 		 448 aa  278  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  35.41 
 
 		 370 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  38.14 
 
 		 387 aa  253  6e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30630  predicted protein  25.39 
 
 		 417 aa  92.8  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44622  predicted protein  24.73 
 
 		 485 aa  86.7  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  48.53 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  45.59 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  26.01 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  22.82 
 
 		 366 aa  67  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  43.94 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  26.15 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  42.03 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  23.36 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55137  acyl desaturase  23.92 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  23.17 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  24.73 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  43.75 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  34.83 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  39.13 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  22.09 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  39.24 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  22.67 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  27.48 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  46.55 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  35.29 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  43.1 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  32.35 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  25.93 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  33.72 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  23.24 
 
 		 365 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  22.42 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  23.88 
 
 		 459 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  23.77 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  23.99 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  23.13 
 
 		 362 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  33.71 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  37.68 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  25.66 
 
 		 357 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  38.46 
 
 		 366 aa  53.1  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  28.87 
 
 		 321 aa  52.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  24.22 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  22.95 
 
 		 469 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  39.66 
 
 		 347 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  24.26 
 
 		 365 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>