99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3992 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3992  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 272 aa  529  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2678  transcriptional regulator for mhp operon  52.61 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1863  IclR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020859  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1685  transcriptional regulator, IclR family  38.55 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.857691  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0926  DNA-binding transcriptional activator MhpR  33.33 
 
 		 270 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0269  DNA-binding transcriptional activator MhpR  31.44 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4534  DNA-binding transcriptional activator MhpR  32.96 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2112  IclR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 268 aa  99  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0897  DNA-binding transcriptional activator MhpR  31.14 
 
 		 278 aa  95.9  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000478423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2330  DNA-binding transcriptional activator MhpR  30.68 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.497147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3062  DNA-binding transcriptional activator MhpR  31.92 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15090  DNA-binding transcriptional activator MhpR  32.36 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774699  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7409  Transcriptional regulator  31.76 
 
 		 285 aa  90.1  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0839  IclR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0410  DNA-binding transcriptional activator MhpR  30.68 
 
 		 315 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000385619  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0370  DNA-binding transcriptional activator MhpR  30.68 
 
 		 315 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000653427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0377  DNA-binding transcriptional activator MhpR  29.92 
 
 		 281 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000713598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0421  DNA-binding transcriptional activator MhpR  29.92 
 
 		 281 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3279  DNA-binding transcriptional activator MhpR  29.92 
 
 		 281 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000040145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0834  DNA-binding transcriptional activator MhpR  33.87 
 
 		 264 aa  85.5  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3260  transcriptional regulator, IclR family  29.55 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000124832  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00300  DNA-binding transcriptional activator, 3HPP-binding  29.92 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000821038  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00304  hypothetical protein  29.55 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000752199  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7402  Transcriptional regulator  29.54 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2069  hypothetical protein  44.17 
 
 		 138 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0931  DNA-binding transcriptional activator MhpR  31.47 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2750  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2608  regulatory protein, IclR  28.79 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.460452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2552  IclR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1978  DNA-binding transcriptional activator MhpR  28.68 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184195  normal  0.111389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1294  IclR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 256 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0051  DNA-binding transcriptional activator MhpR  27.52 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56430  putative transcriptional regulator  27.61 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4911  putative transcriptional regulator  27.41 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.803448  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  29.87 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3751  DNA-binding transcriptional activator MhpR  24.53 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3024  DNA-binding transcriptional activator MhpR  24.53 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1670  regulatory protein, IclR  30.93 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0894994  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  28.52 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3345  regulatory protein, IclR  28.04 
 
 		 269 aa  52.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  27.83 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  28.33 
 
 		 265 aa  50.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  30.3 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  31.18 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0800  transcriptional regulator  29.53 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  25.21 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 230 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  30.54 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4980  regulatory protein IclR  28.02 
 
 		 260 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.0161062 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2070  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 75 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 275 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 275 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 275 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 295 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  30.28 
 
 		 265 aa  46.2  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2760  hypothetical protein  27.94 
 
 		 271 aa  45.8  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202707  normal  0.0135051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  27.23 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  29.19 
 
 		 265 aa  45.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  24.31 
 
 		 254 aa  45.8  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2369  regulatory proteins, IclR  28.09 
 
 		 287 aa  45.8  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  27.82 
 
 		 254 aa  45.8  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0691  IclR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 260 aa  45.4  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  25.5 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  29.88 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  29.69 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  28.49 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6258  transcriptional regulator, IclR family  31.09 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  25.7 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  25.85 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2487  transcriptional regulator KdgR  28.57 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.823978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  25.36 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6215  transcriptional regulator, IclR family  30.49 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0481  transcriptional regulator IclR  33.85 
 
 		 284 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 292 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4893  transcriptional regulator, IclR family  26.96 
 
 		 549 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  23.48 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  31.07 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1841  IclR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  25.38 
 
 		 303 aa  42.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2024  transcriptional regulator, IclR family  30.73 
 
 		 281 aa  42.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.276218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>