More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2247 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0979  NADH dehydrogenase  57.98 
 
 
632 aa  726    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1670  hydrogen dehydrogenase  56.46 
 
 
598 aa  682    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3858  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  61.43 
 
 
603 aa  714    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0528  putative NADH dehydrogenase subunit  60.72 
 
 
610 aa  698    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704697  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2247  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  100 
 
 
627 aa  1279    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.179824  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1462  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  61.63 
 
 
627 aa  723    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.185641 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2724  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  53.33 
 
 
610 aa  622  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000462044  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1217  hydrogenase, NADP-reducing subunit C  48.27 
 
 
588 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.180172 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2751  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  44.93 
 
 
603 aa  474  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1522  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  42.93 
 
 
602 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000148322  hitchhiker  0.000569435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4116  hydrogen dehydrogenase  43.71 
 
 
603 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502813  normal  0.19956 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  43.95 
 
 
545 aa  326  1e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  42.34 
 
 
539 aa  325  2e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4112  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  37.9 
 
 
656 aa  325  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483313  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  43.68 
 
 
545 aa  323  5e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  36.35 
 
 
610 aa  320  5e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  36.78 
 
 
602 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  43.42 
 
 
545 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  37.4 
 
 
607 aa  312  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  37.4 
 
 
607 aa  312  1e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  36.51 
 
 
614 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  38.11 
 
 
596 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  40.21 
 
 
538 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.37 
 
 
426 aa  308  3e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.4 
 
 
448 aa  304  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  42.32 
 
 
488 aa  301  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  41.3 
 
 
407 aa  300  4e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1024  NADH dehydrogenase (quinone)  39.14 
 
 
407 aa  300  5e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0807  NADH dehydrogenase (quinone)  42.29 
 
 
404 aa  299  8e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.52 
 
 
444 aa  299  9e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  37.47 
 
 
552 aa  299  9e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.86 
 
 
447 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.13 
 
 
446 aa  298  1e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  39.55 
 
 
407 aa  298  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
597 aa  298  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.21 
 
 
421 aa  298  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  35.74 
 
 
597 aa  298  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0962  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.27 
 
 
453 aa  296  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089517 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  41.44 
 
 
535 aa  296  7e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  37.99 
 
 
572 aa  296  8e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0877  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.27 
 
 
453 aa  296  9e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  41.33 
 
 
438 aa  295  1e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  34.35 
 
 
614 aa  296  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.81 
 
 
422 aa  294  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 
562 aa  294  4e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  36.8 
 
 
604 aa  294  4e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.26 
 
 
452 aa  294  4e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0216  NADH dehydrogenase (quinone)  39.49 
 
 
425 aa  292  1e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4083  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.05 
 
 
446 aa  292  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.323862  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0784  NADH dehydrogenase (quinone)  39.25 
 
 
408 aa  292  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  39.73 
 
 
425 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  39.73 
 
 
425 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.7 
 
 
449 aa  291  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  34.7 
 
 
636 aa  291  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  34.71 
 
 
636 aa  291  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0926  NADH dehydrogenase I subunit F  42.27 
 
 
431 aa  290  4e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.21 
 
 
451 aa  290  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.42 
 
 
434 aa  290  7e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.69 
 
 
443 aa  290  8e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.94 
 
 
434 aa  290  8e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  38.18 
 
 
448 aa  289  9e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
485 aa  289  1e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.85 
 
 
438 aa  289  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.08 
 
 
456 aa  289  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.55 
 
 
452 aa  288  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  37.58 
 
 
570 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  41.49 
 
 
422 aa  288  2e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.8 
 
 
425 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  36.36 
 
 
569 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.33 
 
 
458 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.26 
 
 
426 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  33.96 
 
 
572 aa  287  4e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.86 
 
 
442 aa  287  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  41.22 
 
 
422 aa  287  5e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.73 
 
 
467 aa  287  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  41.71 
 
 
590 aa  286  5e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  40.56 
 
 
424 aa  286  7e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  37.45 
 
 
596 aa  286  9e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40 
 
 
427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  37.24 
 
 
454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7014  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.63 
 
 
454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  40.21 
 
 
656 aa  286  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40 
 
 
427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.6 
 
 
427 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  35.76 
 
 
626 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1545  NADH dehydrogenase (quinone)  38.7 
 
 
668 aa  285  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.8 
 
 
429 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  41.29 
 
 
530 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  42.59 
 
 
535 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1695  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.64 
 
 
537 aa  284  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.316564  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1564  NADH dehydrogenase I subunit F  40.52 
 
 
461 aa  284  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  41.56 
 
 
436 aa  284  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1458  NADH dehydrogenase I subunit F  40.52 
 
 
461 aa  284  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1812  NADH dehydrogenase I subunit F  40.52 
 
 
461 aa  284  4.0000000000000003e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.848425 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1368  NADH dehydrogenase I subunit F  40 
 
 
445 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.104051  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3423  NADH dehydrogenase I subunit F  40 
 
 
445 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2433  NADH dehydrogenase I subunit F  40 
 
 
445 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2577  NADH dehydrogenase I subunit F  40 
 
 
445 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2660  NADH dehydrogenase I subunit F  40 
 
 
445 aa  283  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.142172  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  34.2 
 
 
594 aa  283  6.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>