62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1646 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1646  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  536  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  26.35 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.45 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.51 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  25.58 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  24.03 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.38 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  23.55 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1255  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.81 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.71 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  24.84 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  24.2 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  27.51 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.62 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.44 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  28 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.57 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  22.17 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  26.55 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  23.1 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.87 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  24.65 
 
 		 304 aa  52.8  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  26.3 
 
 		 317 aa  52.4  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.896113  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  23.08 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1225  hypothetical protein  27.68 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.56 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  22.31 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  20.66 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  24.37 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  23.53 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3210  hypothetical protein  25.58 
 
 		 309 aa  49.7  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  21.77 
 
 		 532 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  25.56 
 
 		 316 aa  49.3  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.79 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.97 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  28.46 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  26.92 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.61 
 
 		 382 aa  47  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  30.89 
 
 		 311 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  28.08 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.96 
 
 		 299 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  22.26 
 
 		 325 aa  46.2  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  22.5 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1833  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.58 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40235  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.22 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  24.25 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  25 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0543  hypothetical protein  23.81 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.530705 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  28.03 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00760  hypothetical protein  27.03 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.99 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.35 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.64 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.42 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0610  hypothetical protein  25 
 
 		 349 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00052369  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  23.21 
 
 		 328 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  22.07 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  24 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0315  hypothetical protein  28.32 
 
 		 286 aa  42.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  26.16 
 
 		 292 aa  42.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>