More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1580 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 475 aa  969    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  57.17 
 
 		 473 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  57.17 
 
 		 473 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  54.01 
 
 		 474 aa  545  1e-154  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  55.72 
 
 		 479 aa  544  1e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  35.69 
 
 		 586 aa  284  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  36.21 
 
 		 481 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  35.32 
 
 		 496 aa  265  1e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  35.15 
 
 		 614 aa  265  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  32.86 
 
 		 484 aa  264  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  38.46 
 
 		 574 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  33.83 
 
 		 486 aa  259  7e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  32.72 
 
 		 481 aa  257  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 589 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  33.8 
 
 		 617 aa  253  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  33.62 
 
 		 481 aa  253  6e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  33.2 
 
 		 588 aa  253  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  34.03 
 
 		 586 aa  253  7e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  34.03 
 
 		 586 aa  253  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  34.03 
 
 		 586 aa  253  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  34.03 
 
 		 586 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  33.82 
 
 		 586 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  33.82 
 
 		 586 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  31.42 
 
 		 477 aa  250  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  33.82 
 
 		 586 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  32.99 
 
 		 481 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  32.99 
 
 		 586 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  32.99 
 
 		 586 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1265  alpha amylase catalytic region  35.64 
 
 		 463 aa  247  4e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  32.15 
 
 		 488 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  31.47 
 
 		 487 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  33.96 
 
 		 586 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  36.09 
 
 		 578 aa  241  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  33.94 
 
 		 587 aa  241  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  33.19 
 
 		 586 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  33.04 
 
 		 663 aa  239  1e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  33.62 
 
 		 493 aa  238  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  35.54 
 
 		 582 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  32.61 
 
 		 486 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  32.61 
 
 		 486 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  36.2 
 
 		 472 aa  232  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  31.61 
 
 		 481 aa  231  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  34.3 
 
 		 483 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  35.33 
 
 		 605 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  35.33 
 
 		 605 aa  225  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  35.33 
 
 		 605 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  35.33 
 
 		 605 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  35.33 
 
 		 605 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  35.33 
 
 		 605 aa  225  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  31.99 
 
 		 608 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  35.33 
 
 		 604 aa  223  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  35.02 
 
 		 605 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  35.33 
 
 		 605 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  37.72 
 
 		 576 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  34.56 
 
 		 605 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  35.02 
 
 		 605 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  34.03 
 
 		 607 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  33.17 
 
 		 476 aa  221  3e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  34.79 
 
 		 605 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  35.32 
 
 		 609 aa  220  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  35.96 
 
 		 610 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  35.28 
 
 		 600 aa  220  6e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  35.32 
 
 		 609 aa  219  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  35.71 
 
 		 610 aa  219  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  34.41 
 
 		 584 aa  219  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  35.4 
 
 		 605 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  34.36 
 
 		 583 aa  218  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  32.77 
 
 		 1145 aa  216  7e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  32.22 
 
 		 606 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  30.78 
 
 		 608 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 576 aa  212  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  29.8 
 
 		 1847 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  33.41 
 
 		 575 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  32.07 
 
 		 589 aa  211  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  31.61 
 
 		 580 aa  206  9e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  31.57 
 
 		 651 aa  204  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17020  glycosidase  30.08 
 
 		 727 aa  203  7e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  33.4 
 
 		 659 aa  202  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  32.77 
 
 		 480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  31.59 
 
 		 459 aa  199  7e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  30.6 
 
 		 914 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13890  glycosidase  29.26 
 
 		 624 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1524  alpha amylase catalytic region  31.21 
 
 		 634 aa  197  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  33.25 
 
 		 574 aa  194  2e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  29.07 
 
 		 1299 aa  195  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  33.02 
 
 		 1175 aa  193  6e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3328  maltodextrin glucosidase  29.49 
 
 		 596 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  29.38 
 
 		 1193 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  28.22 
 
 		 1401 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  28.83 
 
 		 1307 aa  186  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0286  alpha amylase catalytic region  28.37 
 
 		 611 aa  186  9e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.109454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  27.59 
 
 		 1643 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5858  alpha amylase catalytic region  27.82 
 
 		 569 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.364305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  27.92 
 
 		 1401 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4682  alpha amylase catalytic region  29.61 
 
 		 609 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0938  maltodextrin glucosidase  27.63 
 
 		 590 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2294  alpha amylase catalytic region  26.48 
 
 		 611 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0747  alpha amylase, catalytic region  29.78 
 
 		 655 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.29476  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  31.59 
 
 		 622 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  28.43 
 
 		 635 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>