237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0288 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0288  DegV family protein  100 
 
 		 273 aa  543  1e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0322  DegV family protein  42.07 
 
 		 277 aa  203  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0615  DegV family protein  38.71 
 
 		 282 aa  175  8e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0323  DegV family protein  37.02 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  33.21 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1271  DegV family protein  30.47 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.724491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  34.98 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  32.62 
 
 		 281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  31.16 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  32.61 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  32.13 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1941  degV family protein  26.43 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.676322  normal  0.0830662 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  33.21 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  31.27 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  31.27 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  30.15 
 
 		 282 aa  106  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1346  degV family protein  30.25 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000423289  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  30.82 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  31.52 
 
 		 281 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  30.65 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  30 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  29.89 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0258  hypothetical protein  28.26 
 
 		 595 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  29.62 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0171  DegV family protein  27.17 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0263  hypothetical protein  27.9 
 
 		 595 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  31.8 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  26.47 
 
 		 279 aa  99.4  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  29.29 
 
 		 287 aa  99.4  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  29.3 
 
 		 280 aa  98.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0602  degV family protein  27.37 
 
 		 281 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17350  degV family protein  26.88 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173682  hitchhiker  0.00667437 
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  29.69 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  30.11 
 
 		 280 aa  96.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  30.66 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  30.4 
 
 		 280 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  30.4 
 
 		 280 aa  96.3  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  30.4 
 
 		 280 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  27.99 
 
 		 281 aa  96.3  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  30.4 
 
 		 287 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  28.92 
 
 		 326 aa  96.3  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  28.31 
 
 		 277 aa  96.3  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  30.4 
 
 		 287 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  30.18 
 
 		 282 aa  95.9  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  30.18 
 
 		 282 aa  95.9  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  29.93 
 
 		 280 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  32.57 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  29.58 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1430  degV family protein  28.28 
 
 		 827 aa  94.7  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  25.18 
 
 		 637 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  29.67 
 
 		 280 aa  94  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  23.38 
 
 		 683 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  29.11 
 
 		 280 aa  94  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  34.74 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  26.64 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  31.65 
 
 		 286 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  30.18 
 
 		 283 aa  93.2  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  35.41 
 
 		 281 aa  93.2  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  32.61 
 
 		 286 aa  93.2  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  30.03 
 
 		 280 aa  92.8  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  29.3 
 
 		 282 aa  92.8  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  30.14 
 
 		 286 aa  92.4  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  32.01 
 
 		 286 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  31.45 
 
 		 290 aa  92.4  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  31.9 
 
 		 286 aa  92  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  31.65 
 
 		 286 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  31.65 
 
 		 286 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  31.65 
 
 		 286 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  28.31 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  29.62 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  31.65 
 
 		 286 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl590  putative fatty acid binding/lipid transport protein  27.92 
 
 		 276 aa  89.7  4e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.929007  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  27.7 
 
 		 286 aa  90.1  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  29.29 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  29.79 
 
 		 293 aa  89.4  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  31.29 
 
 		 286 aa  89  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  24.46 
 
 		 283 aa  89  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  25.27 
 
 		 281 aa  89  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  25.27 
 
 		 279 aa  89  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  27.94 
 
 		 279 aa  89  9e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  26.16 
 
 		 282 aa  89  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  26.09 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  28.93 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0126  hypothetical protein  29.27 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000467213  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  25.36 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  35.64 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1656  hypothetical protein  27.99 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1521  hypothetical protein  26.76 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  25.76 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  29.2 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  31.18 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  25.38 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2384  degV family protein  28.04 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  27.7 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09170  degV family protein  26.79 
 
 		 301 aa  85.9  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.266589 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2628  degV family protein  33.33 
 
 		 268 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108949  decreased coverage  0.000000230039 
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  27.66 
 
 		 279 aa  85.5  9e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  27.24 
 
 		 287 aa  85.5  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2436  hypothetical protein  33.33 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2398  hypothetical protein  33.33 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.419302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>