More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2740 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2740  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 
225 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1144  hypothetical protein  49.01 
 
 
217 aa  191  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.422721  normal  0.397537 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3086  protein of unknown function UPF0126  45.85 
 
 
222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2951  hypothetical protein  46.12 
 
 
217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.184845 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3187  protein of unknown function UPF0126  45.37 
 
 
222 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.120724  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2988  hypothetical protein  45.85 
 
 
222 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00741318  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  34.13 
 
 
206 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20410  predicted membrane protein  39.49 
 
 
303 aa  106  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4671  protein of unknown function UPF0126  35.29 
 
 
245 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0543686  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  36.07 
 
 
218 aa  102  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  37.88 
 
 
211 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  39.29 
 
 
206 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  38.73 
 
 
203 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  29.84 
 
 
211 aa  99  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  36.51 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  34.74 
 
 
215 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  29.17 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1926  protein of unknown function UPF0126  36.41 
 
 
230 aa  97.1  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3728  hypothetical protein  35.47 
 
 
208 aa  97.4  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  36.41 
 
 
238 aa  95.9  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  36.67 
 
 
211 aa  95.5  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  35.57 
 
 
207 aa  94.7  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  33.88 
 
 
206 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  33.88 
 
 
206 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  37.44 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  41.77 
 
 
219 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  94  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  36.98 
 
 
201 aa  93.2  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  35.65 
 
 
211 aa  92.4  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  36.09 
 
 
207 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  34.3 
 
 
209 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2399  protein of unknown function UPF0126  30.92 
 
 
264 aa  92  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.53799 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2715  protein of unknown function UPF0126  30.69 
 
 
317 aa  91.7  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  37.89 
 
 
246 aa  91.7  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  33.85 
 
 
208 aa  91.7  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  31.55 
 
 
211 aa  91.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  36.71 
 
 
207 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2426  hypothetical protein  34.02 
 
 
207 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  36.08 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4861  hypothetical protein  35.03 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  35.05 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1035  protein of unknown function UPF0126  37.34 
 
 
207 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  35.57 
 
 
207 aa  89.7  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  31.12 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  33.5 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  31.71 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  34.91 
 
 
207 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  35.05 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0933  hypothetical protein  37.5 
 
 
207 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  31.55 
 
 
217 aa  89  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  38.56 
 
 
204 aa  89  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3402  protein of unknown function UPF0126  40.41 
 
 
217 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525112  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0493  hypothetical protein  37.5 
 
 
207 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0972  hypothetical protein  37.5 
 
 
207 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0632  hypothetical protein  36.71 
 
 
206 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1175  hypothetical protein  38.41 
 
 
212 aa  89  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  38.71 
 
 
208 aa  89  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  33.17 
 
 
208 aa  88.6  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2344  hypothetical protein  34.32 
 
 
207 aa  88.6  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.740415  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4075  hypothetical protein  37.5 
 
 
207 aa  88.6  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0584  hypothetical protein  33.17 
 
 
263 aa  88.2  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  30.37 
 
 
203 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  30.37 
 
 
203 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  35.05 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  32.56 
 
 
218 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  36.08 
 
 
211 aa  88.2  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1558  yadS protein  36.84 
 
 
206 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0721  hypothetical protein  32.14 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  30.37 
 
 
203 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2619  hypothetical protein  36.32 
 
 
206 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2125  hypothetical protein  36.32 
 
 
206 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.255131  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  29.52 
 
 
209 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  29.52 
 
 
209 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0844  hypothetical protein  37.65 
 
 
207 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  34.87 
 
 
208 aa  87  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0787  hypothetical protein  36.32 
 
 
206 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181124  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0832  hypothetical protein  37.65 
 
 
207 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3127  hypothetical protein  38.85 
 
 
223 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1993  hypothetical protein  36.32 
 
 
206 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  35.05 
 
 
208 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  30.85 
 
 
205 aa  86.7  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2993  hypothetical protein  36.32 
 
 
206 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  31.25 
 
 
203 aa  86.3  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3081  hypothetical protein  36.32 
 
 
206 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  30.73 
 
 
203 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  37.2 
 
 
218 aa  86.3  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  35.05 
 
 
208 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  35.05 
 
 
208 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  35.05 
 
 
208 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  30.37 
 
 
203 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  30.48 
 
 
213 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  30.48 
 
 
213 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  30.48 
 
 
213 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  30.48 
 
 
213 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  36.13 
 
 
209 aa  85.9  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  30.89 
 
 
202 aa  85.9  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  35.79 
 
 
222 aa  85.9  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  32.62 
 
 
213 aa  85.9  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  32.62 
 
 
213 aa  85.9  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  32.62 
 
 
213 aa  85.9  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>