More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0889 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  100 
 
 
495 aa  932    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  63.94 
 
 
493 aa  497  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  63.32 
 
 
486 aa  482  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  58.78 
 
 
509 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  48.48 
 
 
483 aa  431  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  53.29 
 
 
486 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  51.96 
 
 
487 aa  411  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  48.73 
 
 
506 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  47.53 
 
 
490 aa  397  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  49.26 
 
 
491 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  46 
 
 
483 aa  391  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  48.31 
 
 
531 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  46.63 
 
 
566 aa  368  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  39.78 
 
 
552 aa  366  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  50.21 
 
 
481 aa  363  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  47.44 
 
 
516 aa  351  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  44.09 
 
 
509 aa  350  2e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  46.17 
 
 
533 aa  348  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  43.58 
 
 
557 aa  347  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  43.36 
 
 
660 aa  345  1e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  48.37 
 
 
517 aa  344  2e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  52.42 
 
 
485 aa  342  9e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  44.16 
 
 
540 aa  333  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  44.84 
 
 
607 aa  333  4e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  41.39 
 
 
522 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  41.16 
 
 
502 aa  330  4e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  48.9 
 
 
502 aa  327  4.0000000000000003e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  40.96 
 
 
520 aa  316  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  40.96 
 
 
520 aa  316  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  40.73 
 
 
513 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  44.91 
 
 
596 aa  297  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  40.73 
 
 
466 aa  287  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  39.18 
 
 
458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  41.51 
 
 
468 aa  283  7.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  39.36 
 
 
467 aa  274  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  37.25 
 
 
572 aa  271  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  35.6 
 
 
478 aa  263  4e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  38.49 
 
 
522 aa  253  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  34.62 
 
 
531 aa  243  7.999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  33.33 
 
 
456 aa  239  8e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  35.98 
 
 
499 aa  233  4.0000000000000004e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  34.02 
 
 
536 aa  228  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  36.67 
 
 
455 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  37.03 
 
 
456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  37.95 
 
 
482 aa  221  3e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  36.63 
 
 
473 aa  219  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  35.49 
 
 
466 aa  219  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  35.89 
 
 
474 aa  218  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  34.93 
 
 
463 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  35.34 
 
 
462 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  36.09 
 
 
466 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  30.62 
 
 
487 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  35.86 
 
 
466 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  35.86 
 
 
466 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  34.85 
 
 
456 aa  215  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  35.86 
 
 
466 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  35.32 
 
 
464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  32.99 
 
 
465 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  34.14 
 
 
464 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  36.1 
 
 
456 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  34.11 
 
 
457 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  34.17 
 
 
467 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  34.17 
 
 
467 aa  211  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  37.38 
 
 
453 aa  209  7e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  32.16 
 
 
534 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  32.16 
 
 
534 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  34.29 
 
 
466 aa  209  9e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  32.16 
 
 
534 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  33.63 
 
 
447 aa  199  9e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  31.06 
 
 
543 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  36.49 
 
 
462 aa  194  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  35.25 
 
 
459 aa  194  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  34.91 
 
 
460 aa  192  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  35.04 
 
 
459 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  29.02 
 
 
498 aa  183  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0029  Sodium/sulphate symporter  30.45 
 
 
450 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  28.69 
 
 
467 aa  176  9e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  35.73 
 
 
476 aa  174  3.9999999999999995e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  32.99 
 
 
472 aa  167  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2334  anion transporter  31.35 
 
 
454 aa  166  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  33.33 
 
 
471 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  30.93 
 
 
482 aa  164  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  33.49 
 
 
471 aa  163  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  29.89 
 
 
491 aa  161  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3210  anion transporter  37.65 
 
 
442 aa  159  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  28.22 
 
 
459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  31.58 
 
 
478 aa  154  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  30.79 
 
 
487 aa  154  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  28.83 
 
 
470 aa  153  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  30.46 
 
 
472 aa  152  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  29.95 
 
 
482 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  30 
 
 
474 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  30.97 
 
 
579 aa  147  5e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  26.38 
 
 
446 aa  146  9e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  29.7 
 
 
483 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3450  anion transporter  32.46 
 
 
511 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502589  normal  0.0319564 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  30.3 
 
 
449 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0639  putative membrane transporter  29 
 
 
570 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  27.74 
 
 
516 aa  140  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  29.72 
 
 
482 aa  140  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>