More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0486 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  100 
 
 
495 aa  998    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  56.14 
 
 
497 aa  552  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  50.6 
 
 
493 aa  506  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  50.91 
 
 
492 aa  478  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  47.47 
 
 
491 aa  458  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  48.49 
 
 
501 aa  457  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  47.19 
 
 
497 aa  449  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  45.7 
 
 
490 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  46.89 
 
 
495 aa  438  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  46.96 
 
 
496 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  47.51 
 
 
534 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  47.9 
 
 
521 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  46.98 
 
 
496 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  46.76 
 
 
544 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  46.48 
 
 
504 aa  430  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  45.77 
 
 
497 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  45.77 
 
 
497 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  47.08 
 
 
494 aa  428  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  45.36 
 
 
497 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  46.17 
 
 
498 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  45.36 
 
 
498 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  44.15 
 
 
497 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  46.15 
 
 
499 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  44.02 
 
 
496 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  39.36 
 
 
496 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  39.36 
 
 
496 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  40.76 
 
 
497 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  40.68 
 
 
486 aa  368  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.2 
 
 
502 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  39.37 
 
 
535 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  40.2 
 
 
494 aa  356  5.999999999999999e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  39.52 
 
 
490 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  40.82 
 
 
549 aa  355  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  38.33 
 
 
532 aa  352  8e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  38.57 
 
 
498 aa  350  4e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  37.58 
 
 
496 aa  330  3e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  34.85 
 
 
549 aa  312  6.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  33.1 
 
 
578 aa  302  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  37.07 
 
 
494 aa  302  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  34.21 
 
 
492 aa  296  5e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  34.67 
 
 
551 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  34.99 
 
 
556 aa  270  5e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  34.01 
 
 
556 aa  264  3e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  32.92 
 
 
474 aa  262  8e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  52.99 
 
 
288 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.21 
 
 
270 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.21 
 
 
270 aa  237  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  50.21 
 
 
254 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  50.21 
 
 
270 aa  237  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  50.21 
 
 
254 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  51.52 
 
 
267 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  52.5 
 
 
259 aa  237  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  50.21 
 
 
270 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  51.08 
 
 
267 aa  236  9e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  50 
 
 
270 aa  234  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  49.61 
 
 
308 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  49.57 
 
 
270 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  49.59 
 
 
258 aa  229  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  46.75 
 
 
609 aa  226  8e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  55.84 
 
 
264 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  46.32 
 
 
270 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  47.49 
 
 
261 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  51.03 
 
 
263 aa  205  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  44.93 
 
 
279 aa  194  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2168  hypothetical protein  42.13 
 
 
294 aa  170  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219464  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  40.72 
 
 
289 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1642  hypothetical protein  39.91 
 
 
294 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.263612  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0013  hypothetical protein  39.91 
 
 
294 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.501718  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1381  hypothetical protein  36.84 
 
 
289 aa  158  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  35.75 
 
 
262 aa  157  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3677  hypothetical protein  39.29 
 
 
274 aa  157  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1082  protein of unknown function DUF344  41.67 
 
 
317 aa  156  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  38.94 
 
 
304 aa  156  8e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  37.67 
 
 
328 aa  156  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0107  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.23 
 
 
305 aa  156  9e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500802  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  39.29 
 
 
311 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  37.5 
 
 
288 aa  154  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2748  protein of unknown function DUF344  44.61 
 
 
347 aa  154  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0446574  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  37.56 
 
 
256 aa  154  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  36.77 
 
 
292 aa  153  8e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  40.54 
 
 
294 aa  153  8e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  36.79 
 
 
284 aa  152  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  37.73 
 
 
329 aa  152  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  35.62 
 
 
276 aa  152  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  35.75 
 
 
301 aa  152  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  36.04 
 
 
309 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1635  hypothetical protein  37.3 
 
 
282 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  38.16 
 
 
304 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5190  hypothetical protein  39.07 
 
 
285 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19577  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  38.16 
 
 
304 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  37.84 
 
 
310 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4290  hypothetical protein  38.55 
 
 
348 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0210  hypothetical protein  35.9 
 
 
292 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0778377  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  37.24 
 
 
338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5527  hypothetical protein  36.76 
 
 
330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912396  normal  0.0122134 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  35.91 
 
 
318 aa  149  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  38.43 
 
 
276 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  37.1 
 
 
258 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4658  protein of unknown function DUF344  38.15 
 
 
334 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.299006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  38.71 
 
 
327 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.839871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>