More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2598 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0706  chaperonin GroEL  68.38 
 
 		 541 aa  696    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  59.77 
 
 		 549 aa  637    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  60 
 
 		 544 aa  637    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07610  chaperonin GroL  67.56 
 
 		 547 aa  690    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  61.21 
 
 		 538 aa  639    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  73.95 
 
 		 542 aa  780    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8122  chaperonin GroEL  66.1 
 
 		 541 aa  682    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  62.86 
 
 		 546 aa  644    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0894  chaperonin GroEL  67.62 
 
 		 544 aa  699    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6001  chaperonin GroEL  72.68 
 
 		 549 aa  728    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2594  chaperonin GroEL  67.47 
 
 		 536 aa  725    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000567378 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  64.93 
 
 		 540 aa  680    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4827  chaperonin GroEL  68 
 
 		 541 aa  687    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  63.76 
 
 		 539 aa  662    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  63.86 
 
 		 547 aa  668    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  67.79 
 
 		 541 aa  707    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  100 
 
 		 537 aa  1061    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  62.95 
 
 		 538 aa  660    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2054  chaperonin GroEL  61.22 
 
 		 544 aa  642    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  67.93 
 
 		 540 aa  718    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07570  chaperonin GroL  68.4 
 
 		 538 aa  733    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130113  normal  0.481128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4257  chaperonin GroEL  78.96 
 
 		 540 aa  811    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  65.78 
 
 		 541 aa  699    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6543  chaperonin GroEL  67.11 
 
 		 541 aa  685    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.14292  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2311  chaperonin GroEL  59.55 
 
 		 547 aa  635    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  62.15 
 
 		 544 aa  645    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  62.24 
 
 		 539 aa  644    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  59.39 
 
 		 546 aa  636    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1918  chaperonin GroEL  63.98 
 
 		 540 aa  657    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04670  chaperonin GroL  67.97 
 
 		 534 aa  711    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0132955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  61.48 
 
 		 538 aa  648    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  68.31 
 
 		 540 aa  706    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  63.69 
 
 		 544 aa  661    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  61.61 
 
 		 543 aa  643    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0488  chaperonin GroEL  62.15 
 
 		 546 aa  650    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00790388  normal  0.0259613 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  61.9 
 
 		 539 aa  654    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  61.79 
 
 		 536 aa  641    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  74.62 
 
 		 540 aa  785    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.208595 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0633  chaperonin GroEL  72.76 
 
 		 546 aa  734    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  65.22 
 
 		 541 aa  681    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  68.95 
 
 		 540 aa  719    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  59.73 
 
 		 548 aa  636    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3358  chaperonin GroEL  60.42 
 
 		 546 aa  636    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  67.81 
 
 		 540 aa  710    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2919  chaperonin GroEL  60.84 
 
 		 547 aa  639    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4231  chaperonin GroEL  69.07 
 
 		 545 aa  714    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732523  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1208  chaperonin GroEL  63.64 
 
 		 543 aa  647    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.730524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  60.79 
 
 		 539 aa  649    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  69.64 
 
 		 544 aa  723    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  64.1 
 
 		 545 aa  667    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0597  chaperonin GroEL  61.41 
 
 		 547 aa  643    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.411178  normal  0.110788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0408  chaperonin GroEL  61.25 
 
 		 545 aa  634    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.522888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34390  chaperonin GroEL  67.93 
 
 		 541 aa  706    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.950181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2189  chaperonin GroEL  59.35 
 
 		 546 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  68 
 
 		 541 aa  701    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1154  chaperonin GroEL  65.78 
 
 		 540 aa  666    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  65.41 
 
 		 540 aa  674    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  60.84 
 
 		 544 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  60.53 
 
 		 542 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0821  chaperonin GroEL  67.43 
 
 		 542 aa  698    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.397191 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  61.52 
 
 		 538 aa  650    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08640  chaperonin GroL  69.26 
 
 		 527 aa  727    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21770  chaperonin GroL  67.8 
 
 		 543 aa  713    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126333  normal  0.154597 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04090  chaperonin GroEL  68.95 
 
 		 546 aa  702    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  62.43 
 
 		 546 aa  670    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  68.19 
 
 		 542 aa  702    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2055  chaperonin GroEL  66.67 
 
 		 543 aa  689    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00350508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  63.38 
 
 		 541 aa  658    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  62.79 
 
 		 547 aa  643    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  67.24 
 
 		 540 aa  699    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  68 
 
 		 545 aa  701    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2886  chaperonin GroEL  67.66 
 
 		 536 aa  719    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00686344  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3841  chaperonin GroEL  68.62 
 
 		 543 aa  685    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  66.67 
 
 		 542 aa  694    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  67.94 
 
 		 545 aa  714    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  68.91 
 
 		 539 aa  718    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  69.58 
 
 		 541 aa  727    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  62.95 
 
 		 538 aa  660    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0804  chaperonin GroEL  68.76 
 
 		 540 aa  712    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16540  chaperonin GroEL  68.22 
 
 		 535 aa  729    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.634552  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3654  chaperonin GroEL  60.11 
 
 		 545 aa  639    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4585  chaperonin GroEL  60.11 
 
 		 545 aa  639    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.3483 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  74.19 
 
 		 541 aa  786    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  68.38 
 
 		 541 aa  717    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  68 
 
 		 541 aa  701    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1171  chaperonin GroEL  65.78 
 
 		 540 aa  666    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.320819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  68.38 
 
 		 541 aa  706    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1495  chaperonin GroEL  63.84 
 
 		 544 aa  643    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601837 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  63.74 
 
 		 538 aa  672    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1172  chaperonin GroEL  61.41 
 
 		 544 aa  639    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368643  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  62.45 
 
 		 539 aa  655    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  61.7 
 
 		 541 aa  647    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0985  chaperonin GroEL  59.74 
 
 		 547 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  68 
 
 		 541 aa  701    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1181  chaperonin GroEL  65.78 
 
 		 540 aa  666    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0347435 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  60.57 
 
 		 543 aa  635    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  66.41 
 
 		 542 aa  672    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  68.19 
 
 		 541 aa  706    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31590  chaperonin GroL  65.72 
 
 		 544 aa  679    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  68 
 
 		 540 aa  711    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>