More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1158 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1445  ABC transporter-like protein  66.67 
 
 		 609 aa  748    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3227  ABC transporter related protein  61.9 
 
 		 609 aa  684    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.393011  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  100 
 
 		 614 aa  1222    Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1926  ABC transporter related  61.45 
 
 		 588 aa  648    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  75.65 
 
 		 615 aa  937    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3978  ABC transporter related protein  59.83 
 
 		 590 aa  680    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5717  ABC transporter related  59.28 
 
 		 620 aa  681    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2929  ABC transporter related protein  66.1 
 
 		 590 aa  730    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  0.358264 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3406  ABC transporter related  61.13 
 
 		 593 aa  688    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169933  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3033  ABC transporter related  59.04 
 
 		 602 aa  660    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  54.92 
 
 		 618 aa  640    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.479998  normal  0.0267692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3180  ABC transporter related  60.2 
 
 		 589 aa  667    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2882  ABC transporter related protein  68.34 
 
 		 600 aa  781    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00823072  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20800  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  54.25 
 
 		 635 aa  628  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.464481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2230  ABC transporter related  54.53 
 
 		 593 aa  606  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1494  ABC transporter related protein  57.69 
 
 		 595 aa  597  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.648483  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27250  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  53.06 
 
 		 626 aa  592  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1994  ABC transporter related protein  57.98 
 
 		 616 aa  580  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0769116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4361  ABC transporter related  55.63 
 
 		 581 aa  577  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1210  ABC transporter related  47.11 
 
 		 615 aa  525  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  35.06 
 
 		 617 aa  346  8e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  43.42 
 
 		 984 aa  345  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  38.27 
 
 		 610 aa  334  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  38.09 
 
 		 610 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  38.09 
 
 		 610 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  36.16 
 
 		 636 aa  329  8e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  37.35 
 
 		 619 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  38.83 
 
 		 1218 aa  325  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  39.2 
 
 		 605 aa  323  5e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0740  ABC transporter related protein  36.42 
 
 		 615 aa  322  9.000000000000001e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  32.25 
 
 		 597 aa  317  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.29 
 
 		 1257 aa  316  6e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  39.08 
 
 		 606 aa  317  6e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  32.7 
 
 		 598 aa  315  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  34.88 
 
 		 600 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  35.17 
 
 		 576 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  34.9 
 
 		 614 aa  310  4e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  32.16 
 
 		 605 aa  309  9e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  34.96 
 
 		 608 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  37.09 
 
 		 1522 aa  308  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  31.92 
 
 		 587 aa  307  4.0000000000000004e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  34.41 
 
 		 614 aa  306  7e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  37.69 
 
 		 631 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  37.69 
 
 		 631 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  37.69 
 
 		 631 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  32.71 
 
 		 597 aa  303  8.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  32.71 
 
 		 597 aa  303  8.000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  36.61 
 
 		 615 aa  302  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  34.01 
 
 		 609 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  34.64 
 
 		 764 aa  300  5e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  30.68 
 
 		 598 aa  299  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  31.91 
 
 		 618 aa  299  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  37.8 
 
 		 634 aa  299  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0911  ABC transporter related  34.7 
 
 		 640 aa  297  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0397453  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.12 
 
 		 598 aa  296  9e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  33.39 
 
 		 726 aa  296  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  34.05 
 
 		 596 aa  296  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  32.64 
 
 		 594 aa  295  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  31.93 
 
 		 598 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.93 
 
 		 598 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.93 
 
 		 598 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  32.67 
 
 		 592 aa  293  4e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  36.31 
 
 		 592 aa  294  4e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  36.28 
 
 		 652 aa  293  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  36.54 
 
 		 634 aa  293  6e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.93 
 
 		 598 aa  293  7e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  33.06 
 
 		 589 aa  293  7e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.26 
 
 		 598 aa  293  7e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  36.22 
 
 		 1301 aa  293  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  31.28 
 
 		 589 aa  293  9e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  32.33 
 
 		 588 aa  293  9e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  37.6 
 
 		 1436 aa  292  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  37.58 
 
 		 606 aa  291  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.93 
 
 		 598 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.25 
 
 		 598 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  35.84 
 
 		 567 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  33.03 
 
 		 773 aa  291  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  36.02 
 
 		 567 aa  292  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  32.41 
 
 		 572 aa  291  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  34.76 
 
 		 598 aa  290  5.0000000000000004e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.78 
 
 		 622 aa  290  6e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  37.25 
 
 		 625 aa  290  7e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  30.77 
 
 		 598 aa  289  9e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.89 
 
 		 598 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  31.65 
 
 		 617 aa  289  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  36.82 
 
 		 1230 aa  288  2e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  31.34 
 
 		 593 aa  288  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.67 
 
 		 608 aa  288  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1554  ABC transporter related  33.94 
 
 		 612 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138935  hitchhiker  0.00285078 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  30.02 
 
 		 597 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.85 
 
 		 589 aa  288  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.12 
 
 		 567 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  33.06 
 
 		 608 aa  287  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  36.23 
 
 		 620 aa  287  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  32.85 
 
 		 568 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  34.52 
 
 		 1284 aa  286  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  32.98 
 
 		 572 aa  286  9e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  31.12 
 
 		 572 aa  286  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  31.12 
 
 		 572 aa  286  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3344  ABC transporter related  36.35 
 
 		 615 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>