100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0808 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0808  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  100 
 
 		 362 aa  739    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000170863  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1649  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  61.41 
 
 		 359 aa  465  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0129  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  60.34 
 
 		 371 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000445979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0150  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  65.22 
 
 		 360 aa  465  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0173  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  59.66 
 
 		 357 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696733  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0249  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  60.51 
 
 		 370 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00032725  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0115  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  57.82 
 
 		 364 aa  425  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000323099  hitchhiker  0.00167749 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00730  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  55.71 
 
 		 362 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000274075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  42.31 
 
 		 691 aa  300  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  45.05 
 
 		 681 aa  299  4e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  42.15 
 
 		 685 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  41.87 
 
 		 685 aa  286  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  43.21 
 
 		 728 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  43.49 
 
 		 728 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  39.84 
 
 		 720 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  38.61 
 
 		 710 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  39.04 
 
 		 707 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  38.77 
 
 		 707 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  36.29 
 
 		 689 aa  222  9e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  37.4 
 
 		 684 aa  219  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  31.43 
 
 		 891 aa  203  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  32.88 
 
 		 845 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1254  protein of unknown function DUF205  36.31 
 
 		 574 aa  176  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  32.99 
 
 		 955 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5680  hypothetical protein  32.29 
 
 		 366 aa  159  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0387198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0989  hypothetical protein  34.48 
 
 		 556 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.39207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1012  hypothetical protein  31.47 
 
 		 560 aa  149  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0262179  hitchhiker  0.000000557566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2946  aminotransferase class-III  30.77 
 
 		 957 aa  133  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0399  hypothetical protein  29.18 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247515  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2279  hypothetical protein  30.68 
 
 		 339 aa  122  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0898  dehydrogenase-like protein  27.75 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0872  dehydrogenase like protein  27.75 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2534  hypothetical protein  28.45 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1594  hypothetical protein  28.78 
 
 		 341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.293919 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.2 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121651  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05891  dehydrogenase  27.64 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0334693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2973  aminotransferase class-III  26.14 
 
 		 956 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1864  dehydrogenase  27.07 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05591  dehydrogenase  27.01 
 
 		 346 aa  109  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2782  pyridoxalphosphate dependent aminotransferase, class III  25.82 
 
 		 959 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05891  dehydrogenase  26.72 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.735878  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05971  dehydrogenase  25.92 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05361  dehydrogenase  25.43 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0533  hypothetical protein  26.76 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1634  hypothetical protein  24.79 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.509196  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0729  hypothetical protein  26.38 
 
 		 346 aa  93.2  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07811  hypothetical protein  30.65 
 
 		 191 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4755  hypothetical protein  24.13 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0898505  normal  0.0689026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2005  hypothetical protein  24.5 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375654  normal  0.0926262 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  27.78 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  24.69 
 
 		 4101 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5475  glutamyl-tRNA reductase  27.18 
 
 		 441 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  27.44 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  27.44 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  26.34 
 
 		 418 aa  50.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  27.44 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  22.65 
 
 		 432 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  30.14 
 
 		 418 aa  49.7  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4205  glutamyl-tRNA reductase  26.09 
 
 		 423 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 456 aa  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2896  hypothetical protein  28.74 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  27.49 
 
 		 420 aa  47.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  27.92 
 
 		 422 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  21.67 
 
 		 428 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  21.67 
 
 		 428 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  27.92 
 
 		 422 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  28.65 
 
 		 443 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  22.16 
 
 		 431 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  32.73 
 
 		 434 aa  46.6  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  28.04 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  33.06 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  27.41 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  29.03 
 
 		 441 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  29.21 
 
 		 425 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  34.95 
 
 		 325 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  31.58 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  24.5 
 
 		 423 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  26.34 
 
 		 379 aa  44.3  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  29.75 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6649  ectoine utilization protein EutC  29.67 
 
 		 334 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  29.46 
 
 		 448 aa  43.5  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  27.14 
 
 		 425 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  33.98 
 
 		 325 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2461  glutamyl-tRNA reductase  28.83 
 
 		 420 aa  43.1  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000933086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  27.14 
 
 		 425 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  33.01 
 
 		 325 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  28.14 
 
 		 425 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2067  glutamyl-tRNA reductase  28.83 
 
 		 420 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.85694e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  27.14 
 
 		 425 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0851  glutamyl-tRNA reductase  24.02 
 
 		 426 aa  43.1  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.307966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54134  glutamyl-trna reductase  24.74 
 
 		 512 aa  43.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0214782  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  26.36 
 
 		 416 aa  43.1  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  27.14 
 
 		 425 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06560  shikimate 5-dehydrogenase  23.46 
 
 		 291 aa  43.1  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  35.79 
 
 		 338 aa  43.1  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  25.61 
 
 		 432 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  25.61 
 
 		 432 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  28.97 
 
 		 418 aa  42.7  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  27.92 
 
 		 444 aa  42.7  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  28.14 
 
 		 425 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>