More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0828 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  65.58 
 
 
603 aa  826    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  56.29 
 
 
596 aa  665    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  70.21 
 
 
602 aa  848    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  58.36 
 
 
619 aa  712    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  56.17 
 
 
601 aa  702    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  59.29 
 
 
590 aa  653    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  61.2 
 
 
591 aa  765    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  71.62 
 
 
601 aa  890    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  71.07 
 
 
601 aa  889    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  100 
 
 
596 aa  1210    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  71.79 
 
 
601 aa  891    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  55.84 
 
 
596 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  59.64 
 
 
590 aa  667    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  58.12 
 
 
590 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  56.46 
 
 
596 aa  665    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  57.68 
 
 
590 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  56.03 
 
 
596 aa  694    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  51.81 
 
 
625 aa  629  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  52.77 
 
 
595 aa  619  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  49.75 
 
 
620 aa  610  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  47.59 
 
 
595 aa  529  1e-149  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  41.96 
 
 
650 aa  479  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  42.13 
 
 
644 aa  463  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  40 
 
 
660 aa  457  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  41.91 
 
 
648 aa  444  1e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3174  ABC transporter related  39.73 
 
 
750 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  43.15 
 
 
658 aa  437  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  38.59 
 
 
638 aa  430  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  38.35 
 
 
651 aa  429  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4137  ABC transporter related protein  34.68 
 
 
718 aa  411  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3603  ABC transporter related  37.97 
 
 
962 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0813652  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  37.08 
 
 
639 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  36.71 
 
 
585 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
629 aa  388  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1550  ABC transporter related  38.21 
 
 
589 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.759268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  36.58 
 
 
575 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0402  ABC transporter related  34.12 
 
 
645 aa  368  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.176731  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0913  ABC transporter related  34.55 
 
 
678 aa  366  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00146704 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  38.61 
 
 
556 aa  363  6e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  38.97 
 
 
588 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  34.15 
 
 
581 aa  353  5e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  35.3 
 
 
607 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  35.27 
 
 
768 aa  350  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  33.33 
 
 
571 aa  350  5e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.16 
 
 
571 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.16 
 
 
571 aa  348  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.16 
 
 
571 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.55 
 
 
1257 aa  348  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  36.07 
 
 
764 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.16 
 
 
571 aa  348  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  34.59 
 
 
580 aa  347  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.16 
 
 
571 aa  347  4e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.16 
 
 
571 aa  346  6e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  36.55 
 
 
1436 aa  346  6e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  35.96 
 
 
597 aa  346  8e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.97 
 
 
571 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  32.99 
 
 
571 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.99 
 
 
571 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  35.01 
 
 
594 aa  345  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  35.36 
 
 
617 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  38.05 
 
 
584 aa  343  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  34.12 
 
 
607 aa  343  4e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  36.23 
 
 
592 aa  343  4e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  35.65 
 
 
581 aa  343  5e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  35.27 
 
 
768 aa  343  5e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  35.27 
 
 
814 aa  343  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  35.99 
 
 
760 aa  342  8e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  35.69 
 
 
600 aa  342  9e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  33.5 
 
 
597 aa  342  1e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.9 
 
 
587 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  33.79 
 
 
581 aa  342  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  33.5 
 
 
597 aa  342  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  35.46 
 
 
610 aa  342  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  38.65 
 
 
586 aa  341  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  38.7 
 
 
598 aa  341  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  33.79 
 
 
587 aa  341  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  36.66 
 
 
671 aa  341  2e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  33.79 
 
 
587 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.79 
 
 
587 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.79 
 
 
587 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  37.74 
 
 
620 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  34.97 
 
 
773 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  33.62 
 
 
587 aa  340  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  35.45 
 
 
784 aa  340  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.92 
 
 
598 aa  340  5e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  34.94 
 
 
782 aa  340  5.9999999999999996e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.9 
 
 
587 aa  339  7e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  32.83 
 
 
587 aa  339  7e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  33.85 
 
 
636 aa  339  8e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  33.69 
 
 
582 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  37.96 
 
 
750 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  38.16 
 
 
770 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  34.16 
 
 
568 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  34.25 
 
 
726 aa  337  3.9999999999999995e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  34.47 
 
 
582 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  34.76 
 
 
600 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  35.29 
 
 
582 aa  336  7e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  33.39 
 
 
572 aa  336  7.999999999999999e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  33.79 
 
 
587 aa  336  9e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  32.88 
 
 
587 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>