More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4351 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4351  ribosomal protein L10  100 
 
 
184 aa  354  3.9999999999999996e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  76.57 
 
 
174 aa  255  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  75.43 
 
 
174 aa  246  9e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  73.56 
 
 
175 aa  242  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  72.09 
 
 
175 aa  242  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  69.19 
 
 
228 aa  226  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  65.54 
 
 
187 aa  219  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  66.28 
 
 
182 aa  218  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  67.06 
 
 
174 aa  216  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  66.85 
 
 
176 aa  209  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  63.78 
 
 
203 aa  209  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  69.59 
 
 
175 aa  203  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  58.82 
 
 
202 aa  203  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  60.89 
 
 
181 aa  202  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  67.63 
 
 
173 aa  198  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  61.45 
 
 
181 aa  197  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  66.47 
 
 
173 aa  197  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  58.62 
 
 
200 aa  194  9e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  56.57 
 
 
174 aa  192  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  59.06 
 
 
184 aa  191  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  65.9 
 
 
212 aa  188  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  55.62 
 
 
178 aa  187  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  60.57 
 
 
178 aa  187  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  60.69 
 
 
172 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  57.8 
 
 
172 aa  185  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  57.8 
 
 
173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  55.49 
 
 
173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  55.49 
 
 
173 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0678  ribosomal protein L10  55.29 
 
 
190 aa  179  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  58.24 
 
 
181 aa  178  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0966  50S ribosomal protein L10  56.18 
 
 
175 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.968319  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0984  50S ribosomal protein L10  56.18 
 
 
175 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270382  normal  0.351336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0994  50S ribosomal protein L10  55.88 
 
 
175 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1252  50S ribosomal protein L10  55 
 
 
179 aa  169  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.268065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2702  50S ribosomal protein L10  62.58 
 
 
197 aa  168  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5101  50S ribosomal protein L10  54.44 
 
 
179 aa  167  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2990  50S ribosomal protein L10  61.94 
 
 
196 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.302741  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0750  ribosomal protein L10  53.89 
 
 
176 aa  160  9e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  46.75 
 
 
174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  45.11 
 
 
179 aa  134  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  44.19 
 
 
176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  44.57 
 
 
172 aa  119  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  42.61 
 
 
172 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  41.07 
 
 
174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  40 
 
 
176 aa  112  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  40.23 
 
 
173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  40.23 
 
 
173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  39.08 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  42.46 
 
 
170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  42.69 
 
 
174 aa  107  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  42.21 
 
 
166 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  44.37 
 
 
166 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  37.87 
 
 
175 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  44.16 
 
 
166 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  38.86 
 
 
175 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 
166 aa  104  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 
166 aa  104  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 
166 aa  104  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 
166 aa  104  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 
166 aa  104  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 
166 aa  104  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 
166 aa  104  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 
166 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 
166 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  37.57 
 
 
174 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  41.61 
 
 
256 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 
166 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  37.71 
 
 
174 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  37.36 
 
 
173 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  35.5 
 
 
178 aa  102  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  39.31 
 
 
174 aa  101  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  36.31 
 
 
179 aa  100  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  36.31 
 
 
179 aa  100  9e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  35.84 
 
 
172 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  38.96 
 
 
166 aa  99.8  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  38.96 
 
 
166 aa  99.8  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  41.61 
 
 
176 aa  99  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  39.77 
 
 
176 aa  99  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 
174 aa  98.6  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  37.04 
 
 
173 aa  98.6  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  37.09 
 
 
205 aa  97.1  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 
172 aa  96.7  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  42.55 
 
 
178 aa  96.7  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  37.04 
 
 
173 aa  95.9  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  35.91 
 
 
181 aa  95.9  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 
181 aa  95.1  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  39.22 
 
 
166 aa  95.1  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  34.46 
 
 
178 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  39.87 
 
 
167 aa  94.4  8e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  38.29 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  37.36 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  37.71 
 
 
174 aa  92.4  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  36.88 
 
 
166 aa  92  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2554  50S ribosomal protein L10  34.29 
 
 
181 aa  91.7  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140545  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  34.88 
 
 
177 aa  91.3  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4678  50S ribosomal protein L10  36.22 
 
 
182 aa  91.3  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000989378  decreased coverage  0.00291158 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27791  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 
175 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  32.14 
 
 
181 aa  90.5  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  33.53 
 
 
176 aa  90.5  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  39.33 
 
 
197 aa  89.7  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>