More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3829 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3829  protein of unknown function DUF140  100 
 
 
288 aa  564  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0519  protein of unknown function DUF140  64.11 
 
 
288 aa  349  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3024  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  66.3 
 
 
288 aa  342  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0702  hypothetical protein  55.23 
 
 
275 aa  267  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03710  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  49.37 
 
 
279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6633  protein of unknown function DUF140  48.01 
 
 
279 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1129  protein of unknown function DUF140  47.64 
 
 
275 aa  246  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4347  protein of unknown function DUF140  50.63 
 
 
282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09370  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  45.91 
 
 
281 aa  242  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.989082  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2825  hypothetical protein  50.63 
 
 
279 aa  240  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2249  protein of unknown function DUF140  45.62 
 
 
279 aa  232  6e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4618  hypothetical protein  47.06 
 
 
280 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4706  hypothetical protein  47.06 
 
 
280 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5001  hypothetical protein  47.06 
 
 
280 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0265  hypothetical protein  46.64 
 
 
285 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0274  hypothetical protein  46.64 
 
 
285 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0284  hypothetical protein  46.64 
 
 
285 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.236886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1595  hypothetical protein  44.56 
 
 
280 aa  222  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192555  normal  0.463053 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1508  protein of unknown function DUF140  41.22 
 
 
286 aa  222  7e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200147  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0857  hypothetical protein  47.9 
 
 
262 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1245  protein of unknown function DUF140  45.61 
 
 
287 aa  218  7.999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1555  hypothetical protein  46.64 
 
 
280 aa  215  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4539  hypothetical protein  42.7 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.108981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2850  hypothetical protein  45.8 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5203  hypothetical protein  46.64 
 
 
280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3685  hypothetical protein  44.12 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3672  hypothetical protein  44.12 
 
 
285 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3745  hypothetical protein  44.12 
 
 
285 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4171  protein of unknown function DUF140  44.78 
 
 
285 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4171  hypothetical protein  45.38 
 
 
284 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4189  hypothetical protein  45.26 
 
 
285 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.462632  normal  0.824407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0362  hypothetical protein  42.01 
 
 
284 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0958  hypothetical protein  42.11 
 
 
285 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0712  hypothetical protein  45.8 
 
 
290 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0107  hypothetical protein  47.93 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172314  normal  0.949827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3983  hypothetical protein  44.96 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4400  hypothetical protein  40.34 
 
 
281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0011  hypothetical protein  41.2 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305557  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2507  hypothetical protein  44.12 
 
 
285 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.611794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4151  hypothetical protein  44.12 
 
 
285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0921  hypothetical protein  39.22 
 
 
284 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.423738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4111  hypothetical protein  46.03 
 
 
281 aa  195  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304605  normal  0.164442 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11996  integral membrane protein YrbE3b  46.22 
 
 
271 aa  194  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.586486  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4605  hypothetical protein  41.18 
 
 
284 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.855439  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0117  hypothetical protein  47.93 
 
 
296 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0126  hypothetical protein  47.93 
 
 
296 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.505339  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0133  hypothetical protein  47.39 
 
 
289 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1523  hypothetical protein  43.03 
 
 
272 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1546  hypothetical protein  43.03 
 
 
284 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2987  protein of unknown function DUF140  40.28 
 
 
288 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3951  protein of unknown function DUF140  49.79 
 
 
283 aa  188  9e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2100  hypothetical protein  42.75 
 
 
284 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10599  integral membrane protein YrbE2b  47.87 
 
 
295 aa  185  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13534  integral membrane protein YrbE4b  46.64 
 
 
280 aa  185  9e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000417284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0834  hypothetical protein  43.23 
 
 
281 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3790  protein of unknown function DUF140  40.59 
 
 
284 aa  177  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1626  hypothetical protein  42.62 
 
 
285 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1677  hypothetical protein  42.62 
 
 
285 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0653  hypothetical protein  42.62 
 
 
285 aa  175  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135154  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0499  hypothetical protein  42.62 
 
 
285 aa  175  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204404  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10169  integral membrane protein YrbE1b  42.08 
 
 
289 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1709  protein of unknown function DUF140  37.86 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  31.2 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  33.06 
 
 
261 aa  116  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  35.92 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  33.85 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  34.27 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  29.91 
 
 
256 aa  109  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  31.74 
 
 
264 aa  109  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  32.59 
 
 
267 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  29.74 
 
 
261 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  32.66 
 
 
251 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  32.66 
 
 
251 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  32.66 
 
 
251 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  30.57 
 
 
257 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  34.76 
 
 
270 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  29.48 
 
 
261 aa  105  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  33.47 
 
 
263 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  33.18 
 
 
267 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  33.47 
 
 
263 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  29.35 
 
 
265 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  32.85 
 
 
260 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0506  toluene tolerance protein Ttg2B  29.64 
 
 
264 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  31.53 
 
 
258 aa  103  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3630  hypothetical protein  28.86 
 
 
260 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485791  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  31.09 
 
 
257 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  31.03 
 
 
261 aa  102  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  28.99 
 
 
265 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  29.7 
 
 
261 aa  102  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  27.99 
 
 
260 aa  102  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  28.57 
 
 
312 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  28.26 
 
 
266 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  28.26 
 
 
265 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  29.27 
 
 
265 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  29.7 
 
 
261 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  29.7 
 
 
261 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  29.59 
 
 
261 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  30.17 
 
 
261 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  30.17 
 
 
261 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  30.17 
 
 
261 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>